We will learn computational methods -- algorithms and data structures -- for analyzing DNA sequencing data. We will learn a little about DNA, genomics, and how DNA sequencing is used. We will use Python to implement key algorithms and data structures and to analyze real genomes and DNA sequencing datasets.
от партнера
Университет Джонса ХопкинсаОб этом курсе
Недавно просмотрено: 30 735
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Прибл. 12 часов на выполнение
Английский
Субтитры: Арабский, Французский, Португальский (Европа), Итальянский, Вьетнамский, Немецкий, Русский, Английский, Испанский
Приобретаемые навыки
- Bioinformatics Algorithms
- Algorithms
- Python Programming
- Algorithms On Strings
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Прибл. 12 часов на выполнение
Английский
Субтитры: Арабский, Французский, Португальский (Европа), Итальянский, Вьетнамский, Немецкий, Русский, Английский, Испанский
от партнера
Университет Джонса Хопкинса
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Программа курса: что вы изучите
4 ч. на завершение
DNA sequencing, strings and matching
This module we begin our exploration of algorithms for analyzing DNA sequencing data. We'll discuss DNA sequencing technology, its past and present, and how it works.
4 ч. на завершение
19 видео ((всего 112 мин.)), 7 материалов для самостоятельного изучения, 2 тестов
3 ч. на завершение
Preprocessing, indexing and approximate matching
In this module, we learn useful and flexible new algorithms for solving the exact and approximate matching problems. We'll start by learning Boyer-Moore, a fast and very widely used algorithm for exact matching
3 ч. на завершение
15 видео ((всего 114 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 2 тестов
3 ч. на завершение
Edit distance, assembly, overlaps
This week we finish our discussion of read alignment by learning about algorithms that solve both the edit distance problem and related biosequence analysis problems, like global and local alignment.
3 ч. на завершение
13 видео ((всего 92 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 2 тестов
3 ч. на завершение
Algorithms for assembly
In the last module we began our discussion of the assembly problem and we saw a couple basic principles behind it. In this module, we'll learn a few ways to solve the alignment problem.
3 ч. на завершение
13 видео ((всего 83 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 2 тестов
Рецензии
Лучшие отзывы о курсе АЛГОРИТМЫ ДЛЯ СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДНК
от партнера VK7 авг. 2017 г.
This course provided me a very quick overview of all the core concepts pertaining to DNA sequencing. It is very well organized, crystal clear demonstration of concepts and I really enjoyed the course.
от партнера KP18 мая 2020 г.
Very good course this is. Just a little advice, please make the quiz questions more clear and more specific because one shouldn't waste time to understand a question which is very easy to implement.
от партнера NF9 мар. 2021 г.
very engaging and well-presented course material. intermediate difficulty while conveying the basics of how even recent real-world genome alignment and assembly tools work. great course design!
от партнера LS16 дек. 2021 г.
This course is a great starting point in alignment algorithms. The topics are well explained, but lack practical depth. I strongly recommend this course to any bioinformatician in development!
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Что я получу, оформив подписку на специализацию?
Можно ли получить финансовую помощь?
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
