Об этом курсе
Недавно просмотрено: 11,775

Курс 2 из 7 в программе

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Начальный уровень

Прибл. 16 часов на выполнение

Английский

Субтитры: Английский, Португальский (бразильский), Китайский (упрощенное письмо)

Приобретаемые навыки

AlgorithmsPython ProgrammingWhole Genome SequencingDynamic Programming

Курс 2 из 7 в программе

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Начальный уровень

Прибл. 16 часов на выполнение

Английский

Субтитры: Английский, Португальский (бразильский), Китайский (упрощенное письмо)

Программа курса: что вы изучите

Неделя
1
4 ч. на завершение

Week 1: Introduction to Genome Sequencing

8 видео ((всего 36 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 3 тестов
8 видео
FIELD TRIP!4мин
What Is Genome Sequencing?6мин
Exploding Newspapers4мин
The String Reconstruction Problem3мин
String Reconstruction as a Hamiltonian Path Problem3мин
String Reconstruction as an Eulerian Path Problem5мин
Similar Problems with Different Fates 3мин
2 материала для самостоятельного изучения
Course Details10мин
Week 1 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
Week 1 Quiz15мин
Неделя
2
3 ч. на завершение

Week 2: Applying Euler's Theorem to Assemble Genomes

5 видео ((всего 28 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 3 тестов
5 видео
Euler's Theorem 6мин
Assembling Read-Pairs 8мин
De Bruijn Graphs Face Harsh Realities of Assembly 4мин
Returning to Konigsberg 1мин
1 материал для самостоятельного изучения
Week 2 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
Week 2 Quiz15мин
Неделя
3
4 ч. на завершение

Week 3: Sequencing Antibiotics

5 видео ((всего 27 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 3 тестов
5 видео
How Do Bacteria Make Antibiotics? 8мин
Sequencing Antibiotics by Shattering Them into Pieces 4мин
A Brute Force Algorithm for Cyclopeptide Sequencing 3мин
Cyclopeptide Sequencing with Branch and Bound 6мин
1 материал для самостоятельного изучения
Week 3 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
Week 3 Quiz15мин
Неделя
4
3 ч. на завершение

Week 4: From Ideal to Real Spectra for Antibiotics Sequencing

4 видео ((всего 18 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 3 тестов
4 видео
From 20 to More than 100 Amino Acids 2мин
The Spectral Convolution Saves the Day 6мин
The Truth About Spectra 2мин
1 материал для самостоятельного изучения
Week 4 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
Week 4 Quiz15мин
4.7
Рецензии: 41Chevron Right

25%

начал новую карьеру, пройдя эти курсы

20%

получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу

Лучшие отзывы о курсе Genome Sequencing (Bioinformatics II)

автор: SVJan 10th 2017

Great course to explore a bit of Bioinformatics for those with no background in Bioinformatics. I love the way the content has been provided, its interactivity increases the interest in the course.

автор: MPDec 8th 2017

I like the real-world tasks, especially the assembly on the final exam. Some of the programming tasks, such as the antibiotic noisy spectrum assembly, are challenging (which is good).

Преподаватели

Avatar

Pavel Pevzner

Professor
Department of Computer Science and Engineering
Avatar

Phillip Compeau

Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering

О Калифорнийский университет в Сан-Диего

UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory....

Специализация Биоинформатика: общие сведения

Join Us in a Top 50 MOOC of All Time! How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth? When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science. Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional! Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video. You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website. Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!...
Биоинформатика

Часто задаваемые вопросы

  • Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.

  • Записавшись на курс, вы получите доступ ко всем курсам в специализации, а также возможность получить сертификат о его прохождении. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.