In previous courses in the Specialization, we have discussed how to sequence and compare genomes. This course will cover advanced topics in finding mutations lurking within DNA and proteins.
Этот курс входит в специализацию ''Специализация Биоинформатика'
от партнера
Специализация БиоинформатикаКалифорнийский университет в Сан-ДиегоОб этом курсе
Недавно просмотрено: 8,674
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Курс 6 из 7 в программе
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Начальный уровень
Прибл. 23 часа на выполнение
Английский
Субтитры: Английский
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Курс 6 из 7 в программе
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Начальный уровень
Прибл. 23 часа на выполнение
Английский
Субтитры: Английский
от партнера
Калифорнийский университет в Сан-Диего
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
Программа курса: что вы изучите
4 ч. на завершение
Week 1: Introduction to Read Mapping
<p>Welcome to our class! We are glad that you decided to join us.</p><p>In this class, we will consider the following two central biological questions (the computational approaches needed to solve them are shown in parentheses):</p><ol><li>How Do We Locate Disease-Causing Mutations? (<em>Combinatorial Pattern Matching</em>)</li><li>Why Have Biologists Still Not Developed an HIV Vaccine? (<em>Hidden Markov Models</em>)</li></ol><p>As in previous courses, each of these two chapters is accompanied by a Bioinformatics Cartoon created by talented artist Randall Christopher and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. You can find the first chapter's cartoon at the bottom of this message. </p><p><img src="https://stepic.org/media/attachments/lessons/292/chapter7_cropped.jpg" title="Image: https://stepic.org/media/attachments/lessons/292/chapter7_cropped.jpg" width="528"></p>
4 ч. на завершение
4 видео ((всего 33 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 3 тестов
4 видео
Why Do We Map Reads? 7мин
Using the Trie 10мин
From a Trie to a Suffix Tree 11мин
2 материала для самостоятельного изучения
Course Details10мин
Week 1 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
How Do We Find Disease-Causing Mutations? (Week 1)15мин
4 ч. на завершение
Week 2: The Burrows-Wheeler Transform
<p>Welcome to week 2 of the class!</p>
4 ч. на завершение
3 видео ((всего 21 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 2 тестов
3 видео
Inverting Burrows-Wheeler 13мин
Using Burrows-Wheeler for Pattern Matching 2мин
1 материал для самостоятельного изучения
Week 2 FAQs (Optional)
4 ч. на завершение
Week 3: Speeding Up Burrows-Wheeler Read Mapping
<p>Welcome to week 3 of class!</p>
4 ч. на завершение
4 видео ((всего 22 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 3 тестов
4 видео
Setting Up Checkpoints 8мин
Inexact Matching 6мин
Further Applications of Read Mapping 2мин
1 материал для самостоятельного изучения
Week 3 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
How Do We Find Disease-Causing Mutations? (Weeks 2-3)20мин
4 ч. на завершение
Week 4: Introduction to Hidden Markov Models
<p>Welcome to week 4 of class!</p>
4 ч. на завершение
5 видео ((всего 42 мин.))
5 видео
Gambling with Yakuza 12мин
From a Crooked Casino to a Hidden Markov Model 9мин
The Decoding Problem 5мин
The Viterbi Algorithm 7мин
Специализация Биоинформатика: общие сведения
Join Us in a Top 50 MOOC of All Time!
How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth?
When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science.
Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional!
Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video.
You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website.
Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.
Что я получу, оформив подписку на специализацию?
Записавшись на курс, вы получите доступ ко всем курсам в специализации, а также возможность получить сертификат о его прохождении. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Какие правила возврата средств?
Когда вы оформите подписку, начнется семидневный бесплатный пробный период, в течение которого подписку можно отменить без штрафа. По истечении этого срока вы не сможете вернуть средства, но сможете отменить подписку в любой момент. Ознакомьтесь с нашей политикой возврата средств.
Можно ли получить финансовую помощь?
Да, Coursera предоставляет финансовую помощь учащимся, которые не могут оплатить обучение. Чтобы подать заявление, перейдите по ссылке "Финансовая помощь" слева под кнопкой "Зарегистрироваться". Заполните форму заявления. Если его примут, вы получите уведомление. Обратите внимание: этот шаг необходимо выполнить для каждого курса специализации, в том числе для дипломного проекта. Подробнее
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
