A big welcome to “Bioinformatics: Introduction and Methods” from Peking University! In this MOOC you will become familiar with the concepts and computational methods in the exciting interdisciplinary field of bioinformatics and their applications in biology, the knowledge and skills in bioinformatics you acquired will help you in your future study and research.
Course materials are available under the CC BY-NC-SA License.
Bioinformatics: Introduction and Methods 生物信息学: 导论与方法
от партнера
Peking University
Программа курса: что вы изучите
Неделя
1Introduction and History of Bioinformatics
Welcome to “Bioinformatics: Introduction and Methods! Upon completion of this module you will be able to: become familiar with the essential concepts of bioinformatics; explore the history of this young area; experience how rapidly bioinformatics is growing. Our supplementary materials will give you a better understanding of the course lectures through they are not required in quizzes or exams
4 видео ((всего 69 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 1 тест
4 видео
History of Bioinformatics30мин
Bioinformatics in Mainland China8мин
About This Course9мин
2 материала для самостоятельного изучения
Readings10мин
Slides10мин
1 практическое упражнение
Introduction and History of Bioinformatics20мин
Неделя
2Sequence Alignment
Upon completion of this module, you will be able to: describe dynamic programming based sequence alignment algorithms; differentiate between the Needleman-Wunsch algorithm for global alignment and the Smith-Waterman algorithm for local alignment; examine the principles behind gap penalty and time complexity calculation which is crucial for you to apply current bioinformatic tools in your research; experience the discovery of Smith-Waterman algorithm with Dr. Michael Waterman himself.
7 видео ((всего 99 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 1 тест
7 видео
Essential Concepts13мин
Global Alignment by Dynamic Programming14мин
From Global to Local6мин
Alignment with Affine Gap Penalty and Calculation of Time Complexity of The Needleman-Wunsch Algorithm6мин
Interview with M. S. Waterman Waterman29мин
Supplement on Homology & Similarity, Similarity Matrix and Dot Matrix (English Subtitles)10мин
Student Presentation (English Subtitles)18мин
2 материала для самостоятельного изучения
Readings10мин
Slides10мин
1 практическое упражнение
Sequence Alignment18мин
Неделя
3Sequence Database Search
Upon completion of this module, you will be able to: become familiar with sequence databse search and most common databases; explore the algoritm behind BLAST and the evaluation of BLAST results; ajdust BLAST parameters base on your own research project.
3 видео ((всего 41 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 1 тест
3 видео
Sequence Databases12мин
BLAST Algorithm: A Primer13мин
Student Presentation (English Subtitles)15мин
2 материала для самостоятельного изучения
Readings10мин
Slides10мин
1 практическое упражнение
Sequence Database Search10мин
Неделя
4Markov Model
Upon completion of this module, you will be able to: recognize state transitions, Markov chain and Markov models; create a hidden Markov model by yourself; make predictuions in a real biological problem with hidden Markov model.
4 видео ((всего 47 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 1 тест
4 видео
Hidden Markov Model11мин
Predict with Hidden Markov Model10мин
Student Presentation16мин
2 материала для самостоятельного изучения
Readings10мин
Slides10мин
1 практическое упражнение
Markov Model 14мин
4.7
Рецензии: 27Лучшие рецензии
автор: FK•Dec 16th 2018
The course has given me a great way to learn Bioinformatics. I especially loved the mode of teaching and the case studies.
Преподавателя
Ge Gao 高歌, Ph.D.
Assistant Professor, Principle InvestigatorCenter for Bioinformatics, School of Life Science
Liping Wei 魏丽萍, Ph.D.
Professor, DirectorCenter for Bioinformatics, School of Life Sciences
О Peking University
Peking University is determined to make its education openly accessible to students in China and around the world. With over 3000 faculty members, Peking University offers excellence in teaching and learning.
Founded in 1898, Peking University (PKU) was the first national comprehensive university in China. For the past 115 years, with its hundreds of thousands of outstanding alumni, Peking University has made prominent contributions in the humanities and sciences to further China's prosperity and progress.
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.
Что я получу, оплатив сертификацию?
Оплатив сертификацию, вы получите доступ ко всем материалам курса, включая оцениваемые задания. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Какие правила возврата средств?
Можно ли получить финансовую помощь?
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
Coursera делает лучшее в мире образование доступным каждому, предлагая онлайн-курсы от ведущих университетов и организаций.
© Coursera Inc., 2018 Все права защищены.
