Об этом курсе

Недавно просмотрено: 9,364
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Средний уровень

This class is geared towards biologists, bacteriologists, and bioinformaticians with a basic knowledge of comparative genomics.

Прибл. 14 часов на выполнение
Английский

Чему вы научитесь

  • Learn how to assemble a bacterial genome

  • Learn how to annotate a bacterial genome

  • Learn how to generate a phylogenetic tree from a set of bacterial genomes

  • Learn how to perform basic comparative analyses of a set of bacterial genomes

Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Средний уровень

This class is geared towards biologists, bacteriologists, and bioinformaticians with a basic knowledge of comparative genomics.

Прибл. 14 часов на выполнение
Английский

от партнера

Placeholder

Виргинский университет

Программа курса: что вы изучите

Неделя
1

Неделя 1

1 ч. на завершение

Introduction

1 ч. на завершение
7 видео ((всего 42 мин.))
7 видео
History of PATRIC and the BRC program3мин
PATRIC overview - tabs and information16мин
Registering and logging on to PATRIC2мин
PATRIC workspace-Create Shared Workspace6мин
Sharing a genome with other PATRIC users4мин
Copying a genome annotation job to a shared workspace3мин
1 практическое упражнение
PATRIC overview, login, and workspace sharing30мин
Неделя
2

Неделя 2

1 ч. на завершение

Assembly

1 ч. на завершение
7 видео ((всего 49 мин.))
7 видео
Uploading read files to the workspace for assembly11мин
Submitting reads to the Genome Assembly Service8мин
Selecting assembly strategies and submitting the assembly job8мин
Monitoring the assembly job and reviewing job results7мин
Genome coverage in Genome Report2мин
Assembly questions and getting help with problems4мин
1 практическое упражнение
Review of genome assembly30мин
Неделя
3

Неделя 3

2 ч. на завершение

Annotation

2 ч. на завершение
7 видео ((всего 77 мин.))
7 видео
Uploading contig files to the PATRIC workspace12мин
Submitting a job to the PATRIC Genome Annotation Service7мин
Reviewing the resulting Genome Report19мин
Downloading the generated files 11мин
Viewing your annotated genome in PATRIC15мин
Finding help or reporting problems with the service5мин
1 практическое упражнение
Review of genome annotation30мин
Неделя
4

Неделя 4

2 ч. на завершение

Comprehensive Genome Analysis

2 ч. на завершение
10 видео ((всего 101 мин.))
10 видео
Submitting a job using reads16мин
Submitting contigs8мин
Full Genome Report13мин
Job Results11мин
Assembly results11мин
Annotation results12мин
Viewing annotated genome12мин
Finding help and citing5мин
Hybrid Assembly Summary8мин
1 практическое упражнение
Review of the Comprehensive Genome Analysis Service30мин

Часто задаваемые вопросы

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.