Об этом курсе
4.7
Оценки: 414
Рецензии: 89

Курс 1 из 7 в программе

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Начальный уровень

Прибл. 14 часа на выполнение

Предполагаемая нагрузка: 4-10 hours/week...

Английский

Субтитры: Английский

Приобретаемые навыки

BioinformaticsBioinformatics AlgorithmsAlgorithmsPython Programming

Курс 1 из 7 в программе

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Начальный уровень

Прибл. 14 часа на выполнение

Предполагаемая нагрузка: 4-10 hours/week...

Английский

Субтитры: Английский

Программа курса: что вы изучите

Неделя
1
3 ч. на завершение

Week 1: Welcome!

<p>Welcome to class!</p><p>This course will focus on two questions at the forefront of modern computational biology, along with the algorithmic approaches we will use to solve them in parentheses:</p><ol><li>Weeks 1-2: Where in the Genome Does DNA Replication Begin? (<em>Algorithmic Warmup</em>)</li><li>Weeks 3-4: Which DNA Patterns Play the Role of Molecular Clocks? (<em>Randomized Algorithms</em>)</li></ol><p>Week 5 will consist of a Bioinformatics Application Challenge in which you will get to apply software for finding DNA motifs to a real biological dataset.</p><p>Each of the two chapters in the course is accompanied by a Bioinformatics Cartoon created by Randall Christopher and serving as a chapter header in the Specialization's bestselling <a href="http://bioinformaticsalgorithms.com" target="_blank">print companion</a>. You can find the first chapter's cartoon at the bottom of this message. What does a cryptic message leading to buried treasure have to do with biology? We hope you will join us to find out!</p><p><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/replication_cropped.jpg" title="Image: http://bioinformaticsalgorithms.com/images/cover/chapter1_cropped.jpg" width="500"></p><p><a href="http://compeau.cbd.cmu.edu" target="_blank"><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/Compeau_caricature.jpg" width ="150"></a> <a href="http://cseweb.ucsd.edu/~ppevzner/" target="_blank"><img src="http://bioinformaticsalgorithms.com/images/Pevzner_caricature.jpg" width ="150"></a></p><p>Phillip and Pavel</p>...
3 видео ((всего 21 мин.)), 3 материалов для самостоятельного изучения, 3 тестов
3 видео
Where in the Genome Does DNA Replication Begin? (Part 1) (11:37)11мин
Where in the Genome Does DNA Replication Begin? (Part 2) (06:24)6мин
3 материала для самостоятельного изучения
Course Details10мин
Week 1 FAQs (Optional)
What is Pseudocode? (Optional)1мин
1 практическое упражнение
Week 1 Quiz15мин
Неделя
2
3 ч. на завершение

Week 2: Finding Replication Origins

<p>Welcome to Week 2 of class!</p> <p>This week, we will examine the biological details of how DNA replication is carried out in the cell. We will then see how to use these details to help us design an intelligent algorithmic approach looking for the replication origin in a bacterial genome.</p>...
2 видео ((всего 13 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 3 тестов
2 видео
Where in the Genome Does DNA Replication Begin? (Part 4) (04:10)4мин
1 материал для самостоятельного изучения
Week 2 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
Week 2 Quiz15мин
Неделя
3
4 ч. на завершение

Week 3: Hunting for Regulatory Motifs

<p>Welcome to Week 3 of class!</p> <p>This week, we begin a new chapter, titled "Which DNA Patterns Play the Role of Molecular Clocks?" At the bottom of this message is this week's Bioinformatics Cartoon. &nbsp;What does a late night casino trip with two 18th Century French mathematicians have in common with finding molecular clocks? &nbsp;Start learning to find out...</p> <p><img src="https://d396qusza40orc.cloudfront.net/bioinformatics%2Fimages%2Fchapter3_final.jpg" title="Image: https://d396qusza40orc.cloudfront.net/bioinformatics%2Fimages%2Fchapter3_final.jpg" width="528"></p>...
3 видео ((всего 23 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 3 тестов
3 видео
From Implanted Patterns to Regulatory Motifs (Part 2) (05:06)5мин
From Implanted Patterns to Regulatory Motifs (Part 3) (07:22)7мин
1 материал для самостоятельного изучения
Week 3 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
Week 3 Quiz15мин
Неделя
4
3 ч. на завершение

Week 4: How Rolling Dice Helps Us Find Regulatory Motifs

<p>Welcome to Week 4 of class!</p> <p>Last week, we encountered a few introductory motif-finding algorithms. This week, we will see how to improve upon these motif-finding approaches by designing randomized algorithms that can "roll dice" to find motifs.</p>...
3 видео ((всего 26 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 3 тестов
3 видео
How Rolling Dice Helps Us Find Regulatory Motifs (Part 2) (05:37)5мин
How Rolling Dice Helps Us Find Regulatory Motifs (Part 3) (07:46)7мин
1 материал для самостоятельного изучения
Week 4 FAQs (Optional)
1 практическое упражнение
Week 4 Quiz15мин
4.7
Рецензии: 89Chevron Right

27%

начал новую карьеру, пройдя эти курсы

21%

получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу

Лучшие рецензии

автор: JLJul 30th 2018

This course is very very good. Challenging at times. It does not hold your hand at all times and sometimes requires research to solve some of the problems, but I like the community and the approach.

автор: LLNov 13th 2017

Very tough but rewarding class. The programming part was easy, the algorithms kicked my butt. Love the challenge and can't wait to take the rest!!! Such an interesting field!

Преподаватели

Avatar

Pavel Pevzner

Professor
Department of Computer Science and Engineering
Avatar

Phillip Compeau

Visiting Researcher
Department of Computer Science & Engineering

О Калифорнийский университет в Сан-Диего

UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory....

О специализации ''Биоинформатика'

Join Us in a Top 50 MOOC of All Time! How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth? When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science. Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional! Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video. You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website. Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!...
Биоинформатика

Часто задаваемые вопросы

  • Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.

  • Записавшись на курс, вы получите доступ ко всем курсам в специализации, а также возможность получить сертификат о его прохождении. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.