Об этом курсе: This course will assist you with recreating work that a previous coworker completed, revisiting a project you abandoned some time ago, or simply reproducing a document with a consistent format and workflow. Incomplete information about how the work was done, where the files are, and which is the most recent version can give rise to many complications. This course focuses on the proper documentation creation process, allowing you and your colleagues to easily reproduce the components of your workflow. Throughout this course, you'll receive helpful demonstrations of RStudio and the R Markdown language and engage in active learning opportunities to help you build a professional online portfolio.
Автор: Emory University
Преподаватели: Melinda Higgins, Associate Research Professor/Senior Biostatistician
School of Nursing
| Уровень | Начинающий |
| Язык | English |
| Как пройти курс | Чтобы пройти курс, выполните все оцениваемые задания. |
| Оценки пользователей |
Программа курса
НЕДЕЛЯ 1
Introduction to Reproducible Research and Dynamic Documentation
This module provides an introduction to the concepts surrounding reproducibility and the Open Science movement, RStudio and GitHub, and foundational cases and authors in the field.
11 видео, 6 материалов для самостоятельного изучения, 1 тренировочный тест
- Материал для самостоятельного изучения: Course Outline and Grading Information
- Видео: Welcome to Week 1!
- Видео: History and Importance of Reproducibility
- Видео: Dynamic Documentation and Literate Programming
- Видео: Components and Examples of Reproducibility
- Материал для самостоятельного изучения: Articles, Resources, and File Organization Examples
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - Links for R and RStudio
- Видео: R and RStudio Introduction
- Материал для самостоятельного изучения: R and RStudio Resources
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - GIT and GitHub
- Видео: Git and Github - Part 1
- Видео: Git and Github - Part 2
- Видео: Git and Github - Part 3
- Видео: Creating Your First Document
- Материал для самостоятельного изучения: Books on Reproducibility and Tools of the Trade
- Тренировочный тест: Practice
- Видео: Wrap-Up
Оцениваемый: Week 1
НЕДЕЛЯ 2
R Markdown: Syntax, Document, and Presentation Formats
This module explores the R Markdown syntax to format and customize the layout of presentations or reports and will also look at inserting and creating objects such as tables, images, or video within documents.
8 видео, 11 материалов для самостоятельного изучения, 1 тренировочный тест
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - Links for R Markdown and YAML
- Видео: Introduction to R Markdown and the YAML Header
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - R Markdown File
- Видео: R Markdown Syntax
- Материал для самостоятельного изучения: R Markdown Resources
- Видео: Figures, Tables, and Equations
- Материал для самостоятельного изучения: Resources for Tables and Equations
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - Media and R Markdown Files
- Видео: Images, Videos, and Footnotes
- Материал для самостоятельного изучения: Resource for Embedding Videos
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - R Markdown File
- Видео: Presentation Formats
- Материал для самостоятельного изучения: Resources for the Presentation Format
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - Link for Bookdown Demo
- Видео: Book Format
- Материал для самостоятельного изучения: Resources for the Book Format
- Тренировочный тест: Practice
- Материал для самостоятельного изучения: [Graded Quiz Prep] - Week 2 Instructions
- Видео: Wrap-Up
Оцениваемый: Week 2
НЕДЕЛЯ 3
R Markdown Templates: Processing and Customizing
This module goes further with R Markdown to help turn documents, reports, and presentations into templates for easier automation, reproducibility, and customization.
9 видео, 6 материалов для самостоятельного изучения, 1 тренировочный тест
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - CSS File
- Видео: Customizing an HTML Document
- Материал для самостоятельного изучения: Note on MD files
- Видео: Customizing a WORD Document
- Видео: Customizing Other Document Formats
- Материал для самостоятельного изучения: Resources for Customizing Documents
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - R Script File
- Видео: Working with R Packages
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - Code File
- Видео: Building a Document Template, Part 1
- Видео: Building a Document Template, Part 2
- Видео: Adding Parameters in a Document Template
- Материал для самостоятельного изучения: Resources for Parameters and Template Development
- Тренировочный тест: Practice
- Видео: Wrap-Up
Оцениваемый: Week 3
НЕДЕЛЯ 4
Leveraging Custom Templates from Leading Scientific Journals
This module delves into custom templates available for websites, books, and scientific publishers, such as Elsevier and the IEEE, with the chance to create your first R Package.
6 видео, 3 материала для самостоятельного изучения, 1 тренировочный тест
- Материал для самостоятельного изучения: Custom Template Packages and References
- Видео: Examples and Demo of Existing Templates
- Видео: Exploring R Packages and Their Components and Files
- Материал для самостоятельного изучения: Resources for Packages and Forking Repositories
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - Code File
- Видео: Create an R Markdown Template and Share It
- Видео: Create an R Package with an R Markdown Template
- Тренировочный тест: Practice
- Видео: Wrap-Up
Оцениваемый: Week 4
НЕДЕЛЯ 5
Working in Teams and Disseminating Templates and Reports
This module focuses on helpful tips for sharing and using the templates you create, as well as methods for organizing content. We'll also look at a few web-publishing services.
6 видео, 2 материала для самостоятельного изучения, 1 тренировочный тест
- Материал для самостоятельного изучения: [Lecture Prep] - Code File
- Видео: Organizing Components - Files, Documents, and Codes
- Видео: Disseminate Your Files via RPubs and GitHub
- Материал для самостоятельного изучения: Resources on Dissemination
- Видео: Communicating to Your Team on How to Use Your Templates and Projects
- Видео: More Ways to Disseminate Your Files
- Тренировочный тест: Practice
- Видео: Wrap-Up
Оцениваемый: Week 5
Часто задаваемые вопросы
Как это работает
Задания курса
Каждый курс — это интерактивный учебник, который содержит видеоматериалы, тесты и проекты.
Помощь сокурсников
Общайтесь с тысячами других учащихся: обсуждайте идеи, материалы курса и помогайте друг другу осваивать новые понятия.
Сертификаты
Получите документы о прохождении курсов и поделитесь своим успехом с друзьями, коллегами и работодателями.
Авторы
Emory University
Emory University, located in Atlanta, Georgia, is one of the world's leading research universities. Its mission is to create, preserve, teach and apply knowledge in the service of humanity.
Стоимость
| Приобрести курс | |
|---|---|
| Получить доступ к материалам курса | Доступен |
| Получить доступ к оцениваемым материалам курса | Доступен |
| Получить итоговую оценку | Доступен |
| Получите сертификат о прохождении курса, ссылкой на который можно делиться с другими людьми | Доступен |
Рейтинги и отзывы
Especially if you are in the first 20 hours of learning to use Git, github, R|RStudio, R Markdown, I think this course will be well-worth your time; an efficient and friendly introduction to those tools/platforms.
Perfect amount of info for beginner and/or intermediate R user who has not taken full advantage of its capabilities (yet)
Coursera делает лучшее в мире образование доступным каждому, предлагая онлайн-курсы от ведущих университетов и организаций.
© Coursera Inc., 2018 Все права защищены.
GC
Well designed with useful practical exercises