This course will assist you with recreating work that a previous coworker completed, revisiting a project you abandoned some time ago, or simply reproducing a document with a consistent format and workflow. Incomplete information about how the work was done, where the files are, and which is the most recent version can give rise to many complications. This course focuses on the proper documentation creation process, allowing you and your colleagues to easily reproduce the components of your workflow. Throughout this course, you'll receive helpful demonstrations of RStudio and the R Markdown language and engage in active learning opportunities to help you build a professional online portfolio.
Reproducible Templates for Analysis and Dissemination
от партнера
Emory University
Программа курса: что вы изучите
Неделя
1Introduction to Reproducible Research and Dynamic Documentation
This module provides an introduction to the concepts surrounding reproducibility and the Open Science movement, RStudio and GitHub, and foundational cases and authors in the field.
11 видео ((всего 75 мин.)), 6 материалов для самостоятельного изучения, 2 тестов
11 видео
Welcome to Week 1!3мин
History and Importance of Reproducibility5мин
Dynamic Documentation and Literate Programming5мин
Components and Examples of Reproducibility8мин
R and RStudio Introduction8мин
Git and Github - Part 112мин
Git and Github - Part 213мин
Git and Github - Part 36мин
Creating Your First Document9мин
Wrap-Up41
6 материалов для самостоятельного изучения
Course Outline and Grading Information5мин
Articles, Resources, and File Organization Examples
[Lecture Prep] - Links for R and RStudio1мин
R and RStudio Resources30мин
[Lecture Prep] - GIT and GitHub5мин
Books on Reproducibility and Tools of the Trade45мин
2 практических упражнения
Practice20мин
Week 130мин
Неделя
2R Markdown: Syntax, Document, and Presentation Formats
This module explores the R Markdown syntax to format and customize the layout of presentations or reports and will also look at inserting and creating objects such as tables, images, or video within documents.
8 видео ((всего 83 мин.)), 11 материалов для самостоятельного изучения, 2 тестов
8 видео
Introduction to R Markdown and the YAML Header10мин
R Markdown Syntax13мин
Figures, Tables, and Equations14мин
Images, Videos, and Footnotes9мин
Presentation Formats16мин
Book Format16мин
Wrap-Up1мин
11 материалов для самостоятельного изучения
[Lecture Prep] - Links for R Markdown and YAML1мин
[Lecture Prep] - R Markdown File1мин
R Markdown Resources30мин
Resources for Tables and Equations25мин
[Lecture Prep] - Media and R Markdown Files1мин
Resource for Embedding Videos5мин
[Lecture Prep] - R Markdown File1мин
Resources for the Presentation Format25мин
[Lecture Prep] - Link for Bookdown Demo3мин
Resources for the Book Format25мин
[Graded Quiz Prep] - Week 2 Instructions5мин
2 практических упражнения
Practice20мин
Week 240мин
Неделя
3R Markdown Templates: Processing and Customizing
This module goes further with R Markdown to help turn documents, reports, and presentations into templates for easier automation, reproducibility, and customization.
9 видео ((всего 93 мин.)), 6 материалов для самостоятельного изучения, 2 тестов
9 видео
Customizing an HTML Document20мин
Customizing a WORD Document8мин
Customizing Other Document Formats10мин
Working with R Packages12мин
Building a Document Template, Part 112мин
Building a Document Template, Part 210мин
Adding Parameters in a Document Template15мин
Wrap-Up58
6 материалов для самостоятельного изучения
[Lecture Prep] - CSS File1мин
Note on MD files3мин
Resources for Customizing Documents40мин
[Lecture Prep] - R Script File1мин
[Lecture Prep] - Code File1мин
Resources for Parameters and Template Development
2 практических упражнения
Practice20мин
Week 330мин
Неделя
4Leveraging Custom Templates from Leading Scientific Journals
This module delves into custom templates available for websites, books, and scientific publishers, such as Elsevier and the IEEE, with the chance to create your first R Package.
6 видео ((всего 47 мин.)), 3 материалов для самостоятельного изучения, 2 тестов
6 видео
Examples and Demo of Existing Templates10мин
Exploring R Packages and Their Components and Files12мин
Create an R Markdown Template and Share It10мин
Create an R Package with an R Markdown Template11мин
Wrap-Up44
3 материала для самостоятельного изучения
Custom Template Packages and References
Resources for Packages and Forking Repositories30мин
[Lecture Prep] - Code File1мин
2 практических упражнения
Practice20мин
Week 430мин
Преподаватель
Melinda Higgins
Associate Research Professor/Senior BiostatisticianSchool of Nursing
О Emory University
Emory University, located in Atlanta, Georgia, is one of the world's leading research universities. Its mission is to create, preserve, teach and apply knowledge in the service of humanity.
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.
Что я получу, оплатив сертификацию?
Оплатив сертификацию, вы получите доступ ко всем материалам курса, включая оцениваемые задания. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Какие правила возврата средств?
Можно ли получить финансовую помощь?
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
Coursera делает лучшее в мире образование доступным каждому, предлагая онлайн-курсы от ведущих университетов и организаций.
© Coursera Inc., 2019 Все права защищены.
