Neurohacking describes how to use the R programming language (https://cran.r-project.org/) and its associated package to perform manipulation, processing, and analysis of neuroimaging data. We focus on publicly-available structural magnetic resonance imaging (MRI). We discuss concepts such as inhomogeneity correction, image registration, and image visualization.
Introduction to Neurohacking In R
Университет Джонса ХопкинсаОб этом курсе
Недавно просмотрено: 18,694
Карьерные результаты учащихся
25%
начал новую карьеру, пройдя эти курсы
11%
получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Промежуточный уровень
Прибл. 9 часов на выполнение
Английский
Субтитры: Английский
Приобретаемые навыки
Image ProcessingBrainR ProgrammingNeurology
Карьерные результаты учащихся
25%
начал новую карьеру, пройдя эти курсы
11%
получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Промежуточный уровень
Прибл. 9 часов на выполнение
Английский
Субтитры: Английский
от партнера
Университет Джонса Хопкинса
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Программа курса: что вы изучите
1 ч. на завершение
Introduction
1 ч. на завершение
3 видео ((всего 30 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 1 тест
1 материал для самостоятельного изучения
Syllabus10мин
1 практическое упражнение
Theme 1 Quiz16мин
2 ч. на завершение
Neuroimaging: Formats and Visualization
In this section, we will discuss different formats that brain images come in, as well as some of the commonly done magnetic resonance imaging (MRI) scans.
2 ч. на завершение
7 видео ((всего 74 мин.))
7 видео
The NIfTI Format9мин
Basic Visualization 19мин
Basic Visualization 29мин
Basic Data Manipulation9мин
Transformations and Smoothing14мин
Basic MRI Contrasts9мин
6 практических упражнений
Theme 2 Lecture 1 Quiz10мин
Theme 2 Lecture 2 Quiz10мин
Theme 2 Lecture 3 Quiz10мин
Theme 2 Lecture 4 Quiz10мин
Theme 2 Lecture 5 Quiz10мин
Theme 2 Lecture 6 Quiz10мин
3 ч. на завершение
Image Processing
In this section, we will discuss the steps done to process brain MRI data. We will discuss inhomogeneity correction, brain extraction or skull stripping, and various image registration techniques.
3 ч. на завершение
9 видео ((всего 71 мин.))
9 видео
Registration15мин
fslr: System Requirements8мин
Bias Field Correction Using fslr3мин
Brain Extraction using fslr5мин
Image Registration Using fslr5мин
Installing ANTsR5мин
Basic Data Manipulation with ANTsR4мин
Pre-Processing with ANTSR7мин
9 практических упражнений
Theme 3 Quiz 110мин
Theme 3 Quiz 210мин
Theme 3 Quiz 312мин
Theme 3 Quiz 410мин
Theme 3 Quiz 510мин
Theme 3 Quiz 610мин
Theme 3 Quiz 710мин
Theme 3 Quiz 810мин
Theme 3 Quiz 910мин
3 ч. на завершение
Extended Image Processing
In this section, we will discuss the different types of registration and how one would go through processing a multi-sequence MRI scan, as well as wrapper functions that make the process much easier. We also cover interactive exploration of brain image data and tissue-level (white/gray matter and cerebrospinal fluid (CSF)) segmentation from a T1-weighted image.
3 ч. на завершение
11 видео ((всего 101 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 10 тестов
11 видео
Co-Registration using fslr9мин
Co-Registration using ANTsR9мин
Wrapper Functions for Processing Pipelines8мин
Across-Visit Co-Registration of T1 Images6мин
Rigid Registration to a Template8мин
Affine Registration of T1 to Template4мин
Nonlinear Registration of T1 to Template6мин
Getting ROI Anatomic Information from Non-Linear Registration12мин
Tissue-Level Segmentation7мин
Papayar: Interactively Viewing Images in R22мин
1 материал для самостоятельного изучения
Papayar Script10мин
10 практических упражнений
Theme 4 Quiz 110мин
Theme 4 Quiz 210мин
Theme 4 Quiz 36мин
Theme 4 Quiz 410мин
Theme 4 Quiz 510мин
Theme 4 Quiz 610мин
Theme 4 Quiz 710мин
Theme 4 Quiz 810мин
Theme 4 Quiz 910мин
Theme 4 Quiz 1010мин
Рецензии
Лучшие отзывы о курсе INTRODUCTION TO NEUROHACKING IN R
от партнера BR8 февр. 2017 г.
I like that this course goes through most necessary steps, my only suggest would be to have one additional week where you go through everything all together, and then do some simple group analysis.
от партнера SJ7 мая 2019 г.
Thank you for the wonderful course. Especially useful when the team explains every new line of code. As a current undergraduate and aspiring neuroscience researcher, this is tremendously helpful.
от партнера AN17 июля 2017 г.
Perfect! Precise to the subject and provides a lot of hands-on details, which is, unfortunately, something that most other similar courses don't do. Absolutely loved it!
от партнера HE16 дек. 2019 г.
A very useful and informative course. An organized, well prepared, and focused course. Thanks to the fabulous team. I learned a lot of stuff related to neuroimaging.
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Access to lectures and assignments depends on your type of enrollment. If you take a course in audit mode, you will be able to see most course materials for free. To access graded assignments and to earn a Certificate, you will need to purchase the Certificate experience, during or after your audit. If you don't see the audit option:
- The course may not offer an audit option. You can try a Free Trial instead, or apply for Financial Aid.
- The course may offer 'Full Course, No Certificate' instead. This option lets you see all course materials, submit required assessments, and get a final grade. This also means that you will not be able to purchase a Certificate experience.
Что я получу, оплатив сертификацию?
Оплатив сертификацию, вы получите доступ ко всем материалам курса, включая оцениваемые задания. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Какие правила возврата средств?
Средства можно вернуть в течение двух недель с момента оплаты или (для только что начавшихся курсов) в течение двух недель после первой сессии, в зависимости от того, какое событие наступит позже. Средства не возвращаются после получения сертификата о прохождении курса, даже если вы закончили курс в течение двухнедельного гарантийного срока. Ознакомьтесь с нашей политикой возврата средств.
Можно ли получить финансовую помощь?
Да, Coursera предоставляет финансовую помощь учащимся, которые не могут оплатить обучение. Чтобы подать заявление, перейдите по ссылке 'Финансовая помощь' слева под кнопкой 'Зарегистрироваться' и заполните форму. Если его примут, вы получите уведомление. Подробнее
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
