Об этом курсе

Недавно просмотрено: 8,592

Neurohacking describes how to use the R programming language (https://cran.r-project.org/) and its associated package to perform manipulation, processing, and analysis of neuroimaging data. We focus on publicly-available structural magnetic resonance imaging (MRI). We discuss concepts such as inhomogeneity correction, image registration, and image visualization.

By the end of this course, you will be able to:

Read/write images of the brain in the NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) format
Visualize and explore these images
Perform inhomogeneity correction, brain extraction, and image registration (within a subject and to a template).

Learner Career Outcomes

25%

начал новую карьеру, пройдя эти курсы

11%

получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Промежуточный уровень

Прибл. 12 часа на выполнение

Предполагаемая нагрузка: 4 weeks of study, 2-4 hours/week...

Английский

Субтитры: Английский

Приобретаемые навыки

Image ProcessingBrainR ProgrammingNeurology

Learner Career Outcomes

25%

начал новую карьеру, пройдя эти курсы

11%

получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Промежуточный уровень

Прибл. 12 часа на выполнение

Предполагаемая нагрузка: 4 weeks of study, 2-4 hours/week...

Английский

Субтитры: Английский

Программа курса: что вы изучите

Неделя

1

1 ч. на завершение

Introduction

3 видео ((всего 30 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 1 тест

3 видео

Meet the Team6мин

Introduction11мин

Structural MRI and R12мин

1 материал для самостоятельного изучения

Syllabus10мин

1 практическое упражнение

Theme 1 Quiz16мин

Неделя

2

2 ч. на завершение

Neuroimaging: Formats and Visualization

In this section, we will discuss different formats that brain images come in, as well as some of the commonly done magnetic resonance imaging (MRI) scans.

7 видео ((всего 74 мин.)), 6 тестов

7 видео

Data Structures and Operations11мин

The NIfTI Format9мин

Basic Visualization 19мин

Basic Visualization 29мин

Basic Data Manipulation9мин

Transformations and Smoothing14мин

Basic MRI Contrasts9мин

6 практического упражнения

Theme 2 Lecture 1 Quiz10мин

Theme 2 Lecture 2 Quiz10мин

Theme 2 Lecture 3 Quiz10мин

Theme 2 Lecture 4 Quiz10мин

Theme 2 Lecture 5 Quiz10мин

Theme 2 Lecture 6 Quiz10мин

Неделя

3

3 ч. на завершение

Image Processing

In this section, we will discuss the steps done to process brain MRI data. We will discuss inhomogeneity correction, brain extraction or skull stripping, and various image registration techniques.

9 видео ((всего 71 мин.)), 9 тестов

9 видео

Preprocessing: An Overview14мин

Registration15мин

fslr: System Requirements8мин

Bias Field Correction Using fslr3мин

Brain Extraction using fslr5мин

Image Registration Using fslr5мин

Installing ANTsR5мин

Basic Data Manipulation with ANTsR4мин

Pre-Processing with ANTSR7мин

9 практического упражнения

Theme 3 Quiz 110мин

Theme 3 Quiz 210мин

Theme 3 Quiz 312мин

Theme 3 Quiz 410мин

Theme 3 Quiz 510мин

Theme 3 Quiz 610мин

Theme 3 Quiz 710мин

Theme 3 Quiz 810мин

Theme 3 Quiz 910мин

Неделя

4

3 ч. на завершение

Extended Image Processing

In this section, we will discuss the different types of registration and how one would go through processing a multi-sequence MRI scan, as well as wrapper functions that make the process much easier. We also cover interactive exploration of brain image data and tissue-level (white/gray matter and cerebrospinal fluid (CSF)) segmentation from a T1-weighted image.

11 видео ((всего 101 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 10 тестов

11 видео

Advanced Brain Image Processing4мин

Co-Registration using fslr9мин

Co-Registration using ANTsR9мин

Wrapper Functions for Processing Pipelines8мин

Across-Visit Co-Registration of T1 Images6мин

Rigid Registration to a Template8мин

Affine Registration of T1 to Template4мин

Nonlinear Registration of T1 to Template6мин

Getting ROI Anatomic Information from Non-Linear Registration12мин

Tissue-Level Segmentation7мин

Papayar: Interactively Viewing Images in R22мин

1 материал для самостоятельного изучения

Papayar Script10мин

10 практического упражнения

Theme 4 Quiz 110мин

Theme 4 Quiz 210мин

Theme 4 Quiz 36мин

Theme 4 Quiz 410мин

Theme 4 Quiz 510мин

Theme 4 Quiz 610мин

Theme 4 Quiz 710мин

Theme 4 Quiz 810мин

Theme 4 Quiz 910мин

Theme 4 Quiz 1010мин

Преподаватели

Часто задаваемые вопросы

Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.
Что я получу, оплатив сертификацию?
Оплатив сертификацию, вы получите доступ ко всем материалам курса, включая оцениваемые задания. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Какие правила возврата средств?
Можно ли получить финансовую помощь?

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.

Introduction to Neurohacking In R