تحليل المجموعات الهرمية باستخدام المسافات الإقليدية

от партнера
Coursera Project Network
В этом Проект с консультациями вы:

فهم أهمية واستخدام المجموعات الهرمية باستخدام ملفات تخصيص الانحراف.

تحدد موقع ملفات الجينوم الفيروسي (cDNA) ومعالجتها لحساب ملفات تعريف الانحراف.

فهم نظرية استخدام معادلة فيثاغورس لحساب المسافة الإقليدية. وتطبيق ذلك باستخدام بايثون لبناء مصفوفة ربط.

Clockساعاتين
IntermediateУчащийся среднего уровня
CloudЗагрузка не требуется
VideoВидео на разделенном экране
Comment DotsАрабский
LaptopТолько для ПК

بنهاية هذا المشروع ، ستنشئ برنامج Python باستخدام واجهة jupyter لتحليل مجموعة من الفيروسات وترسم مخططًا شجرياً أو دندوجرام بناءً على أوجه التشابه فيما بينها. سيعتمد الدندوجرام الذي ستقوم بإنشائه على ملف تعريف الانحراف التراكمي، والذي يعتمد بدوره على تركيبة النوكليوتيدات. ستستخدم تسلسل الجينوم الكامل للعديد من الفيروسات بما في ذلك، كورونا، وفيروس السارس، وفيروس نقص المناعة البشرية، وزيكا، وحمى الضنك، والفيروس المعوي، وفيروسات غرب النيل. ملاحظة: تعمل هذه الدورة التدريبية بشكل أفضل للمتعلمين المقيمين في منطقة أمريكا الشمالية. نعمل حاليًا على توفير نفس التجربة في مناطق أخرى.

Навыки, которые вы получите

  • Python Programming
  • Genomics
  • plotting

Будете учиться пошагово

На видео, которое откроется рядом с рабочей областью, преподаватель объяснит эти шаги:

  1. الخطوة الأولى: مقدمة (توسيع تحليل الانحراف)

  2. الخطوة الثانية: تحديد موقع ملفات البيانات ومعالجتها

  3. الخطوة الثالثة: استيعاب البيانات. فهم مجموعة البيانات الناتجة والتعامل معها

  4. الخطوة الرابعة: التجميع الهرمي - (المقياس - Metric)

  5. الخطوة الخامسة: التجميع الهرمي - (الترتيب والطرق Ordering & Methods)

  6. الخطوة الساسدسة: رسم المخطط الشجري (dendrogram)

  7. الخطوة السابعة: تحليل المخطط الشجري (dendrogram)

  8. الخطوة الثامنة: أخطاء يجب تجنبها

Как устроены проекты с консультациями

Ваше рабочее пространство — это облачный рабочий стол в браузере. Ничего не нужно загружать.

На разделенном экране видео преподаватель предоставляет пошаговые

Часто задаваемые вопросы

Часто задаваемые вопросы

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.