Об этом курсе
Недавно просмотрено: 19,429

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Прибл. 18 часа на выполнение

Английский

Субтитры: Английский

Приобретаемые навыки

StatisticsData AnalysisR ProgrammingBiostatistics

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Прибл. 18 часа на выполнение

Английский

Субтитры: Английский

Программа курса: что вы изучите

Неделя
1
3 ч. на завершение

Module 1

This course is structured to hit the key conceptual ideas of normalization, exploratory analysis, linear modeling, testing, and multiple testing that arise over and over in genomic studies.

...
21 видео ((всего 129 мин.)), 3 материалов для самостоятельного изучения, 1 тест
21 видео
Getting Help (3:44)3мин
What is Data? (4:28)4мин
Representing Data (5:23)5мин
Module 1 Overview (1:07)1мин
Reproducible Research (3:42)3мин
Achieving Reproducible Research (5:02)5мин
R Markdown (6:26)6мин
The Three Tables in Genomics (2:10)2мин
The Three Tables in Genomics (in R) (3:46)3мин
Experimental Design: Variability, Replication, and Power (14:17)14мин
Experimental Design: Confounding and Randomization (9:26)9мин
Exploratory Analysis (9:21)9мин
Exploratory Analysis in R Part I (7:22)7мин
Exploratory Analysis in R Part II (10:07)10мин
Exploratory Analysis in R Part III (7:26)7мин
Data Transforms (7:31)7мин
Clustering (8:43)8мин
Clustering in R (9:09)9мин
3 материала для самостоятельного изучения
Syllabus10мин
Pre Course Survey10мин
Introduction and Materials10мин
1 практическое упражнение
Module 1 Quiz20мин
Неделя
2
2 ч. на завершение

Module 2

This week we will cover preprocessing, linear modeling, and batch effects.

...
14 видео ((всего 97 мин.)), 1 тест
14 видео
Pre-processing and Normalization (11:26)11мин
Quantile Normalization (in R) (4:49)4мин
The Linear Model (6:50)6мин
Linear Models with Categorical Covariates (4:08)4мин
Adjusting for Covariates (4:16)4мин
Linear Regression in R (13:03)13мин
Many Regressions at Once (3:50)3мин
Many Regressions in R (7:21)7мин
Batch Effects and Confounders (7:11)7мин
Batch Effects in R: Part A (8:18)8мин
Batch Effects in R: Part B (3:50)3мин
1 практическое упражнение
Module 2 Quiz20мин
Неделя
3
2 ч. на завершение

Module 3

This week we will cover modeling non-continuous outcomes (like binary or count data), hypothesis testing, and multiple hypothesis testing.

...
15 видео ((всего 86 мин.)), 1 тест
15 видео
GLMs in R (9:28)9мин
Inference (4:18)4мин
Null and Alternative Hypotheses (4:45)4мин
Calculating Statistics (5:11)5мин
Comparing Models (7:08)7мин
Calculating Statistics in R9мин
Permutation (3:26)3мин
Permutation in R (3:33)3мин
P-values (6:04)6мин
Multiple Testing (8:25)8мин
P-values and Multiple Testing in R: Part A (5:58)5мин
P-values and Multiple Testing in R: Part B (4:23)4мин
1 практическое упражнение
Module 3 Quiz20мин
Неделя
4
2 ч. на завершение

Module 4

In this week we will cover a lot of the general pipelines people use to analyze specific data types like RNA-seq, GWAS, ChIP-Seq, and DNA Methylation studies.

...
14 видео ((всего 74 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 1 тест
14 видео
Gene Set Analysis in R (7:43)7мин
The Process for RNA-seq (3:59)3мин
The Process for Chip-Seq (5:25)5мин
The Process for DNA Methylation (5:03)5мин
The Process for GWAS/WGS (6:12)6мин
Combining Data Types (eQTL) (6:04)6мин
eQTL in R (10:36)10мин
Researcher Degrees of Freedom (5:49)5мин
Inference vs. Prediction (8:52)8мин
Knowing When to Get Help (2:31)2мин
Statistics for Genomic Data Science Wrap-Up (1:53)1мин
1 материал для самостоятельного изучения
Post Course Survey10мин
1 практическое упражнение
Module 4 Quiz10мин
4.1
Рецензии: 33Chevron Right

25%

начал новую карьеру, пройдя эти курсы

33%

получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу

25%

стал больше зарабатывать или получил повышение

Лучшие отзывы о курсе Статистика для науки о геномных данных

автор: ZMJun 28th 2018

The professor is really enthusiasm, so I was really impreesed by him. And his teaching is brief, and I can learn key points through the lectures. Great course!

автор: LRMay 23rd 2016

I have really enjoyed the course and I have learnt different concepts relevant for my current study.\n\nYurany

Преподаватели

Avatar

Jeff Leek, PhD

Associate Professor, Biostatistics
Bloomberg School of Public Health

О Университет Джонса Хопкинса

The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world....

О специализации ''Наука о геномных данных'

This specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, Python, R, Bioconductor, and Galaxy. The sequence is a stand alone introduction to genomic data science or a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics. To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit....
Наука о геномных данных

Часто задаваемые вопросы

  • Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.

  • Записавшись на курс, вы получите доступ ко всем курсам в специализации, а также возможность получить сертификат о его прохождении. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.