The field of metagenomics and whole community sequencing is a promising area to unravel the content of microbial communities and their relationship to disease and antimicrobial resistance in the human population. Bioinformatic tools are extremely important for making sense out of metagenomics data, by estimating the presence of pathogens and antimicrobial resistance determinants in complex samples. Combined with relevant explanatory data, metagenomics is a powerful tool for surveillance.
от партнера
Metagenomics applied to surveillance of pathogens and antimicrobial resistance
Датский технический университет (DTU)Об этом курсе
Недавно просмотрено: 11 533
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Прибл. 15 часов на выполнение
Английский
Субтитры: Французский, Португальский (Европа), Русский, Английский, Испанский
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Прибл. 15 часов на выполнение
Английский
Субтитры: Французский, Португальский (Европа), Русский, Английский, Испанский
от партнера
Датский технический университет (DTU)
DTU focuses on research in technical and natural sciences that contributes to the development of society. As an industrially orientated university, our goal is to supply high-level international research based on combining theory with constructing models and empirical methods.
Программа курса: что вы изучите
4 ч. на завершение
From sampling to sequencing
In this module, you will be introduced to metagenomics, some of the considerations and controls that need to be in place in a metagenomics study, and to the topic of antimicrobial resistance.
4 ч. на завершение
10 видео ((всего 112 мин.)), 13 материалов для самостоятельного изучения, 2 тестов
3 ч. на завершение
FROM READS TO RESULTS
In this module, you will be introduced to the basics of bioinformatics analysis of metagenomics data, including the different types of analysis possible and the different algorithms available. You will then learn about quality control, MGmapper and KRAKEN (two freely available bioinformatics pipelines), and ResFinder (a database of antimicrobial resistance genes). An example from a real study will demonstrate some of the challenges of a bioinformatics analysis.
3 ч. на завершение
6 видео ((всего 64 мин.)), 11 материалов для самостоятельного изучения, 1 тест
8 ч. на завершение
Interpretation of results and potential of metagenomics for surveillance
In this module you will learn about two different approaches to analyse and interpret sequence reads - classification and assembly. You will see examples of methods to vizualize read counts and to analyze metagenomics together with explanatory data. Last, you will learn the potential of metagenomics for the development of a future global and integrated surveillance, and the challenges you may encounter during that process
8 ч. на завершение
6 видео ((всего 81 мин.)), 16 материалов для самостоятельного изучения, 6 тестов
Рецензии
Лучшие отзывы о курсе METAGENOMICS APPLIED TO SURVEILLANCE OF PATHOGENS AND ANTIMICROBIAL RESISTANCE
от партнера MQ16 апр. 2020 г.
This course proved helpful in anticipating the very basic idea of metagenomics analysis along with the useful explanation of data interpretation to dig out appropriate results.
от партнера IA28 окт. 2020 г.
I really enjoyed the course. Covered all aspects of a metagenomics project in surveillance of pathogens and AMR, from study design to data analysis and result interpretation.
от партнера MD30 мая 2019 г.
I learned a lot, they covered complex analysis topics in a clear, understandable way. I would recommend this course to anyone interested in microbial metagenomic analysis.
от партнера DD1 авг. 2020 г.
The course was well structured however I had little difficulty in doing last assignments I think some session on problem solving should be done before giving assignments.
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Что я получу, оплатив сертификацию?
Можно ли получить финансовую помощь?
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
