Об этом курсе: Learn to use the tools that are available from the Galaxy Project. This is the second course in the Genomic Big Data Science Specialization.
Автор: Johns Hopkins University
Преподаватели: James Taylor, PhD, Associate Professor of Biology and Computer Science
| Основные сведения | Курс 2 из 8 — Genomic Data Science Specialization |
| Язык | English |
| Как пройти курс | Чтобы пройти курс, выполните все оцениваемые задания. |
| Оценки пользователей |
Программа курса
НЕДЕЛЯ 1
Introduction
This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it.
2 видео, 4 материала для самостоятельного изучения
- Материал для самостоятельного изучения: Welcome
- Материал для самостоятельного изучения: Syllabus
- Материал для самостоятельного изучения: Pre-Course Survey
- Материал для самостоятельного изучения: A Note about AWS
- Видео: Introduction to the Galaxy Platform
Оцениваемый: Module 1 Quiz
НЕДЕЛЯ 2
Galaxy 101
In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis.
3 видео
- Видео: Galaxy 101: Workflows
- Видео: Annotation, Sharing, and Publishing
Оцениваемый: Module 2 Quiz
НЕДЕЛЯ 3
Working with sequence data
In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS.
2 видео
- Видео: ChIP-Sequence Analysis with MACS
Оцениваемый: Module 3 Quiz
НЕДЕЛЯ 4
RNA-seq & Running your own Galaxy
In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy.
4 видео, 2 материала для самостоятельного изучения
- Материал для самостоятельного изучения: TopHat availability
- Видео: RNA Sequence Analysis: Assembly Quantitation, and Differential Expression
- Видео: Installing Galaxy Locally
- Видео: Galaxy on the Cloud
- Материал для самостоятельного изучения: Post-Course Survey
Оцениваемый: Module 4 Quiz
Оцениваемый: Module 5 Quiz
Оцениваемый: Course Project
Часто задаваемые вопросы
Как это работает
Задания курса
Каждый курс — это интерактивный учебник, который содержит видеоматериалы, тесты и проекты.
Помощь сокурсников
Общайтесь с тысячами других учащихся: обсуждайте идеи, материалы курса и помогайте друг другу осваивать новые понятия.
Сертификаты
Получите документы о прохождении курсов и поделитесь своим успехом с друзьями, коллегами и работодателями.
Авторы
Johns Hopkins University
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Стоимость
| Приобрести курс | |
|---|---|
| Получить доступ к материалам курса | Доступен |
| Получить доступ к оцениваемым материалам курса | Доступен |
| Получить итоговую оценку | Доступен |
| Получите сертификат о прохождении курса, ссылкой на который можно делиться с другими людьми | Доступен |
Рейтинги и отзывы
This course is very helpful for postgraduate students dealing with sequence data analysis.
This is a very good beginner course. The only complaint I had on this course would be to have the instructors include 'additional' material that the students could access if they so desired. Some type of 'additional reading' list would be awesome!
Great introduction to a new piece of software I had not yet come across. The lectures were clear and concise, however I felt the coursework was a big step in difficulty and was much harder than the level of the lectures. I also felt I was not equipped with the right knowledge to mark my peers confidently. I would recommend more guidance in the coursework and especially on how to mark it.
Coursera делает лучшее в мире образование доступным каждому, предлагая онлайн-курсы от ведущих университетов и организаций.
© Coursera Inc., 2018 Все права защищены.
DM
Very useful course, do not miss it. It puts a lot of things together. The project will make you work a lot if you really want to learn.