Learn to use the tools that are available from the Galaxy Project. This is the second course in the Genomic Big Data Science Specialization.
Этот курс входит в специализацию ''Специализация Genomic Data Science'
Genomic Data Science with Galaxy
от партнера
Программа курса: что вы изучите
Неделя
1Introduction
This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it.
2 видео ((всего 13 мин.)), 4 материалов для самостоятельного изучения, 1 тест
4 материала для самостоятельного изучения
Welcome10мин
Syllabus10мин
Pre-Course Survey10мин
A Note about AWS10мин
1 практическое упражнение
Module 1 Quiz22мин
Неделя
2Galaxy 101
In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis.
3 видео ((всего 42 мин.)), 1 тест
3 видео
Galaxy 101: Workflows12мин
Annotation, Sharing, and Publishing13мин
1 практическое упражнение
Module 2 Quiz56мин
Неделя
3Working with sequence data
In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS.
2 видео ((всего 25 мин.)), 1 тест
1 практическое упражнение
Module 3 Quiz18мин
Неделя
4RNA-seq & Running your own Galaxy
In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy.
4 видео ((всего 49 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 3 тестов
4 видео
RNA Sequence Analysis: Assembly Quantitation, and Differential Expression12мин
Installing Galaxy Locally8мин
Galaxy on the Cloud19мин
2 материала для самостоятельного изучения
TopHat availability10мин
Post-Course Survey10мин
2 практического упражнения
Module 4 Quiz22мин
Module 5 Quiz20мин
50%
получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу
Лучшие рецензии
автор: BG•Feb 3rd 2018
Great Course if you are interested in dissecting the genome. Galaxy opens up this invisible world and allows even us little people to explore the world once reserved to only Academia.
автор: GK•Sep 6th 2018
This was a lot of work and rewarding to complete. The final project was challenging and the forum contributors helped a lot in pointing out good resources or strategies they had used.
Преподаватель
James Taylor, PhD
Associate Professor of Biology and Computer ScienceО Johns Hopkins University
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
О специализации ''Genomic Data Science'
This specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, Python, R, Bioconductor, and Galaxy. The sequence is a stand alone introduction to genomic data science or a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics.
To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit.
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.
Что я получу, оформив подписку на специализацию?
Записавшись на курс, вы получите доступ ко всем курсам в специализации, а также возможность получить сертификат о его прохождении. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Какие правила возврата средств?
Можно ли получить финансовую помощь?
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
Coursera делает лучшее в мире образование доступным каждому, предлагая онлайн-курсы от ведущих университетов и организаций.
© Coursera Inc., 2018 Все права защищены.
