Об этом курсе: Learn to use the tools that are available from the Galaxy Project. This is the second course in the Genomic Big Data Science Specialization.
Автор: Johns Hopkins University
Преподаватели: James Taylor, PhD, Associate Professor of Biology and Computer Science
| Основные сведения | Курс 2 из 8 — Genomic Data Science Specialization |
| Язык | English |
| Как пройти курс | Чтобы пройти курс, выполните все оцениваемые задания. |
| Оценки пользователей |
Программа курса
НЕДЕЛЯ 1
Introduction
This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it.
2 видео, 4 материала для самостоятельного изучения
- Reading: Welcome
- Reading: Syllabus
- Reading: Pre-Course Survey
- Reading: A Note about AWS
- Видео: Introduction to the Galaxy Platform
Оцениваемый: Module 1 Quiz
НЕДЕЛЯ 2
Galaxy 101
In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis.
3 видео
- Видео: Galaxy 101: Workflows
- Видео: Annotation, Sharing, and Publishing
Оцениваемый: Module 2 Quiz
НЕДЕЛЯ 3
Working with sequence data
In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS.
2 видео
- Видео: ChIP-Sequence Analysis with MACS
Оцениваемый: Module 3 Quiz
НЕДЕЛЯ 4
RNA-seq & Running your own Galaxy
In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy.
4 видео, 2 материала для самостоятельного изучения
- Reading: TopHat availability
- Видео: RNA Sequence Analysis: Assembly Quantitation, and Differential Expression
- Видео: Installing Galaxy Locally
- Видео: Galaxy on the Cloud
- Reading: Post-Course Survey
Оцениваемый: Module 4 Quiz
Оцениваемый: Module 5 Quiz
Оцениваемый: Course Project
Часто задаваемые вопросы
Как это работает
Trabajo del curso
Cada curso es como un libro de texto interactivo, con videos pregrabados, cuestionarios y proyectos.
Ayuda de tus compañeros
Conéctate con miles de estudiantes y debate ideas y materiales del curso, y obtén ayuda para dominar los conceptos.
Certificados
Obtén reconocimiento oficial por tu trabajo y comparte tu éxito con amigos, compañeros y empleadores.
Авторы
Johns Hopkins University
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Стоимость
| Приобрести курс | |
|---|---|
| Получить доступ к материалам курса | Доступен |
| Получить доступ к оцениваемым материалам курса | Доступен |
| Получить итоговую оценку | Доступен |
| Получите сертификат о прохождении курса, ссылкой на который можно делиться с другими людьми | Доступен |
Рейтинги и отзывы
The course is good, I don't feel like I'm very excellent with Galaxy at the end of it
This was a lot of work and rewarding to complete. The final project was challenging and the forum contributors helped a lot in pointing out good resources or strategies they had used.
This course introduces the powerful Genomic software Galaxy, which accesses supercomputers to solve bioinformatics problems. The lectures are very interesting and concise. The final project is challenging since the lectures do not cover the tools required for the project. Fortunately, discussion forum posts by students and Mentors provide guidance about the Galaxy software.
Coursera делает лучшее в мире образование доступным каждому, предлагая онлайн-курсы от ведущих университетов и организаций.
© Coursera Inc., 2018 Все права защищены.
XY
Very useful!