Learn to use the tools that are available from the Galaxy Project. This is the second course in the Genomic Big Data Science Specialization.
от партнера
Специализация Наука о геномных данныхУниверситет Джонса ХопкинсаОб этом курсе
Недавно просмотрено: 72,401
Карьерные результаты учащихся
20%
начал новую карьеру, пройдя эти курсы
14%
получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Курс 2 из 8 в программе
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Прибл. 7 часов на выполнение
Английский
Субтитры: Английский
Приобретаемые навыки
BioinformaticsData AnalysisGenomeGenomics
Карьерные результаты учащихся
20%
начал новую карьеру, пройдя эти курсы
14%
получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Курс 2 из 8 в программе
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Прибл. 7 часов на выполнение
Английский
Субтитры: Английский
от партнера
Университет Джонса Хопкинса
The mission of The Johns Hopkins University is to educate its students and cultivate their capacity for life-long learning, to foster independent and original research, and to bring the benefits of discovery to the world.
Программа курса: что вы изучите
1 ч. на завершение
Introduction
This week, we will present some of the research challenges that motivated the development of the Galaxy framework. We will then introduce Galaxy, describe what the Galaxy framework is, and look at different ways you can use it.
1 ч. на завершение
2 видео ((всего 13 мин.)), 4 материалов для самостоятельного изучения, 1 тест
4 материала для самостоятельного изучения
Welcome10мин
Syllabus10мин
Pre-Course Survey10мин
A Note about AWS10мин
1 практическое упражнение
Module 1 Quiz22мин
2 ч. на завершение
Galaxy 101
In this module and the following modules we will start to use Galaxy to perform different types of analysis.
2 ч. на завершение
3 видео ((всего 42 мин.))
3 видео
Galaxy 101: Workflows12мин
Annotation, Sharing, and Publishing13мин
1 практическое упражнение
Module 2 Quiz56мин
1 ч. на завершение
Working with sequence data
In this module we will be studying sequence data quality control as well as ChIP-Sequence Analysis with MACS.
1 ч. на завершение
2 видео ((всего 25 мин.))
1 практическое упражнение
Module 3 Quiz18мин
4 ч. на завершение
RNA-seq & Running your own Galaxy
In these final modules, we'll take a look at working with sequence data and RNA-seq and at installing and running your own Galaxy.
4 ч. на завершение
4 видео ((всего 49 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 3 тестов
4 видео
RNA Sequence Analysis: Assembly Quantitation, and Differential Expression12мин
Installing Galaxy Locally8мин
Galaxy on the Cloud19мин
2 материала для самостоятельного изучения
TopHat availability10мин
Post-Course Survey10мин
2 практических упражнения
Module 4 Quiz22мин
Module 5 Quiz20мин
Рецензии
Лучшие отзывы о курсе НАУКА О ГЕНОМНЫХ ДАННЫХ С GALAXY
от партнера DT25 авг. 2017 г.
Highly instructive course on using Galaxy. Gives a very good flavour of the benefits, actual workflows and even a bit of administration in terms of installing your own version or a cloud version.
от партнера BG2 февр. 2018 г.
Great Course if you are interested in dissecting the genome. Galaxy opens up this invisible world and allows even us little people to explore the world once reserved to only Academia.
от партнера GK5 сент. 2018 г.
This was a lot of work and rewarding to complete. The final project was challenging and the forum contributors helped a lot in pointing out good resources or strategies they had used.
от партнера RC11 июня 2016 г.
Great instructor with clear and thorough understanding of the material. If you don't have any experience with this technology, this course will walk you through it patiently.
Специализация Наука о геномных данных: общие сведения
With genomics sparks a revolution in medical discoveries, it becomes imperative to be able to better understand the genome, and be able to leverage the data and information from genomic datasets. Genomic Data Science is the field that applies statistics and data science to the genome.
This Specialization covers the concepts and tools to understand, analyze, and interpret data from next generation sequencing experiments. It teaches the most common tools used in genomic data science including how to use the command line, along with a variety of software implementation tools like Python, R, Bioconductor, and Galaxy.
This Specialization is designed to serve as both a standalone introduction to genomic data science or as a perfect compliment to a primary degree or postdoc in biology, molecular biology, or genetics, for scientists in these fields seeking to gain familiarity in data science and statistical tools to better interact with the data in their everyday work.
To audit Genomic Data Science courses for free, visit https://www.coursera.org/jhu, click the course, click Enroll, and select Audit. Please note that you will not receive a Certificate of Completion if you choose to Audit.
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Access to lectures and assignments depends on your type of enrollment. If you take a course in audit mode, you will be able to see most course materials for free. To access graded assignments and to earn a Certificate, you will need to purchase the Certificate experience, during or after your audit. If you don't see the audit option:
- The course may not offer an audit option. You can try a Free Trial instead, or apply for Financial Aid.
- The course may offer 'Full Course, No Certificate' instead. This option lets you see all course materials, submit required assessments, and get a final grade. This also means that you will not be able to purchase a Certificate experience.
Что я получу, оформив подписку на специализацию?
Записавшись на курс, вы получите доступ ко всем курсам в специализации, а также возможность получить сертификат о его прохождении. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Какие правила возврата средств?
Когда вы оформите подписку, начнется семидневный бесплатный пробный период, в течение которого подписку можно отменить без штрафа. По истечении этого срока вы не сможете вернуть средства, но сможете отменить подписку в любой момент. Ознакомьтесь с нашей политикой возврата средств.
Можно ли получить финансовую помощь?
Да, Coursera предоставляет финансовую помощь учащимся, которые не могут оплатить обучение. Чтобы подать заявление, перейдите по ссылке "Финансовая помощь" слева под кнопкой "Зарегистрироваться". Заполните форму заявления. Если его примут, вы получите уведомление. Обратите внимание: этот шаг необходимо выполнить для каждого курса специализации, в том числе для дипломного проекта. Подробнее
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
