Об этом курсе

Недавно просмотрено: 22,864

This course distills for you expert knowledge and skills mastered by professionals in Health Big Data Science and Bioinformatics. You will learn exciting facts about the human body biology and chemistry, genetics, and medicine that will be intertwined with the science of Big Data and skills to harness the avalanche of data openly available at your fingertips and which we are just starting to make sense of. We’ll investigate the different steps required to master Big Data analytics on real datasets, including Next Generation Sequencing data, in a healthcare and biological context, from preparing data for analysis to completing the analysis, interpreting the results, visualizing them, and sharing the results.
Needless to say, when you master these high-demand skills, you will be well positioned to apply for or move to positions in biomedical data analytics and bioinformatics. No matter what your skill levels are in biomedical or technical areas, you will gain highly valuable new or sharpened skills that will make you stand-out as a professional and want to dive even deeper in biomedical Big Data. It is my hope that this course will spark your interest in the vast possibilities offered by publicly available Big Data to better understand, prevent, and treat diseases.

Карьерные результаты учащихся

50%

начал новую карьеру, пройдя эти курсы

43%

получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу

20%

стал больше зарабатывать или получил повышение

Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми

Получите сертификат по завершении

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Продвинутый уровень

Прибл. 40 часов на выполнение

Английский

Субтитры: Французский, Португальский (Европа), Русский, Английский, Испанский

Приобретаемые навыки

BioinformaticsData Clustering AlgorithmsBig DataR Programming

Карьерные результаты учащихся

50%

начал новую карьеру, пройдя эти курсы

43%

получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу

20%

стал больше зарабатывать или получил повышение

Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми

Получите сертификат по завершении

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Продвинутый уровень

Прибл. 40 часов на выполнение

Английский

Субтитры: Французский, Португальский (Европа), Русский, Английский, Испанский

Преподаватели

Оценка преподавателя

4.45/5 (оценок: 22)

Isabelle Bichindaritz

Программа курса: что вы изучите

Оценка контента90%(1,706 оценки)

Неделя

1

Неделя 1

4 ч. на завершение

Genes and Data

After this module, you will be able to

4 ч. на завершение

11 видео ((всего 59 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения, 6 тестов

11 видео

Introduction to the Course1мин

Introduction to Module1мин

DNA and Genes9мин

RNA and Proteins6мин

Transcription Process4мин

Transcription Animation1мин

Translation Process5мин

Translation Animation2мин

Data, Variables, and Big Datasets6мин

Working with cBioPortal - Genetic Data Analysis9мин

Working with cBioPortal - Gene Networks9мин

2 материала для самостоятельного изучения

Module 1 cBioPortal Data Analytics10мин

Module 1 Resources10мин

6 практических упражнений

DNA, RNA, Genes, and Proteins30мин

Transcription and Translation Processes30мин

Data, Variables, and Big Datasets30мин

Working with cBioPortal30мин

Module 1 Quiz30мин

Module 1 cBioPortal Data Analytics30мин

Неделя

2

Неделя 2

8 ч. на завершение

Preparing Datasets for Analysis

After this module, you will be able to:

8 ч. на завершение

13 видео ((всего 75 мин.)), 4 материалов для самостоятельного изучения, 8 тестов

13 видео

Introduction to Module4мин

Datasets and Files10мин

Data Sources11мин

Importance of Data Preprocessing4мин

Data Preprocessing Tasks2мин

Replacing Missing Values3мин

Data Normalization9мин

Data Discretization5мин

Feature Selection3мин

Data Sampling2мин

Principles of R6мин

R Language1мин

Jupyter Notebooks 1017мин

4 материала для самостоятельного изучения

Jupyter Notebooks Essentials10мин

Notebook Module 2 Tutorial10мин

Module 2 R Data Preprocessing10мин

Module 2 Resources10мин

8 практических упражнений

Datasets and Files30мин

Data Preprocessing Tasks30мин

Replacing Missing Values30мин

Normalization and Discretization30мин

Data Reduction30мин

Working with R30мин

Module 2 Quiz30мин

Module 2 R Data Preprocessing30мин

Неделя

3

Неделя 3

7 ч. на завершение

Finding Differentially Expressed Genes

After this module, you will be able to

7 ч. на завершение

9 видео ((всего 53 мин.)), 4 материалов для самостоятельного изучения, 6 тестов

9 видео

Introduction to Module2мин

Overview of Feature Selection Methods13мин

Filter Methods4мин

Wrapper Methods4мин

Evaluation Schemes7мин

Selecting Differentially Expressed Genes3мин

Heatmaps6мин

R Scripts for Feature Selection3мин

Jupyter Notebooks 1017мин

4 материала для самостоятельного изучения

Notebook Module 3 Tutorial10мин

Jupyter Notebooks Essentials10мин

Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes10мин

Module 3 Resources10мин

6 практических упражнений

Feature Selection Methods30мин

Evaluation Schemes30мин

Differentially Expressed Genes30мин

Heatmaps30мин

Module 3 Quiz30мин

Module 3 R Finding Differentially Expressed Genes30мин

Неделя

4

Неделя 4

8 ч. на завершение

Predicting Diseases from Genes

After this module, you will be able to

8 ч. на завершение

12 видео ((всего 85 мин.)), 4 материалов для самостоятельного изучения, 10 тестов

12 видео

Introduction to Module9

Overview of Classification and Prediction Methods8мин

Classification Methods Based on Analogy12мин

Classification Methods Based on Rules13мин

Classification Methods Based on Neural Networks7мин

Classification Methods Based on Statistics3мин

Classification Methods Based on Probabilities7мин

Prediction Methods4мин

Evaluation Schemes13мин

Prediction Workflow4мин

R Scripts for Prediction1мин

Jupyter Notebooks 1017мин

4 материала для самостоятельного изучения

Jupyter Notebooks Essentials10мин

Notebook Module 4 Tutorial10мин

Module 4 R Predicting Diseases from Genes10мин

Module 4 Resources10мин

10 практических упражнений

Overview30мин

Classification with Analogy30мин

Classification based on Rules30мин

Classification with Neural Networks30мин

Classification based on Statistics30мин

Classification based on Probabilities30мин

Prediction Models30мин

Evaluation Schemes30мин

Module 4 Quiz30мин

Module 4 R Predicting Diseases from Genes30мин

Неделя

5

Неделя 5

7 ч. на завершение

Determining Gene Alterations

After this module, you will be able to

1. List different types of gene alterations. 2. Compare and contrast methods for detecting gene mutations. 3. Compare and contrast methods for detecting methylation. 4. Compare and contrast methods for detecting copy number variations. 5. Quantify genomic alterations. 6. Connect genomic alterations to differential expression of genes. 7. Write programs in R for determining gene alterations and their relationship with gene expression.

7 ч. на завершение

9 видео ((всего 81 мин.)), 4 материалов для самостоятельного изучения, 8 тестов

9 видео

Introduction to Module1мин

Overview of Gene Alterations16мин

Genetic Mutations9мин

Finding Genetic Mutations7мин

Methylation8мин

Copy Number Alterations10мин

Genomic Alterations and Gene Expressions16мин

R Scripts for Gene Alterations1мин

Jupyter Notebooks 1017мин

4 материала для самостоятельного изучения

Notebook Module 5 Tutorial10мин

Jupyter Notebooks Essentials10мин

Module 5 R Gene Alterations10мин

Module 5 Resources10мин

8 практических упражнений

Gene Alterations30мин

Gene Mutations30мин

Methylation30мин

Copy Number Alterations30мин

Genomic Alterations and Gene Expressions30мин

Module 5 Quiz (Temporary)30мин

Module 5 Quiz30мин

Module 5 R Gene Alterations30мин

Неделя

6

Неделя 6

6 ч. на завершение

Clustering and Pathway Analysis

After this module, you will be able to 1. Find clusters in biomedical data involving genes.2. Analyze and visualize biological pathways. 3. Write R scripts for clustering and for pathway analysis.

6 ч. на завершение

12 видео ((всего 73 мин.)), 5 материалов для самостоятельного изучения, 5 тестов

12 видео

Introduction to Module2мин

Overview of Clustering Methods7мин

Similarity Assessment8мин

Clustering with KMeans7мин

Density Based Clustering4мин

Hierarchical Clustering6мин

Pathway Analysis12мин

Pathway Discovery7мин

Pathway Visualization6мин

R Scripts for Clustering and Pathway Analysis1мин

Jupyter Notebooks 1017мин

Concluding Remarks1мин

5 материалов для самостоятельного изучения

Jupyter Notebooks Essentials10мин

Notebook Module 6 Tutorial10мин

Module 6 R Clustering and Pathways10мин

Module 6 Resources10мин

Acknowledgements10мин

5 практических упражнений

Clustering30мин

Clustering Methods30мин

Pathways30мин

Module 6 Quiz30мин

Module 6 R Clustering and Pathways30мин

Часто задаваемые вопросы

Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Доступ к лекциям и заданиям предоставляется в зависимости от типа регистрации. Если вы проходите курс в режиме слушателя, то получите бесплатный доступ к большинству материалов курса. Чтобы открыть оцениваемые задания и возможность получить сертификат, необходимо будет приобрести прохождение с сертификатом. Это можно сделать во время прохождения в режиме слушателя или после него. Если вы не видите варианта 'Режим слушателя'.
Курс может не предлагаться в режиме слушателя. Попробуйте бесплатную пробную версию или подайте заявку на финансовую помощь.
Курс предлагаться в режиме 'Полный курс, без сертификата'. В нем можно просматривать все материалы, выполнять обязательные задания и получить итоговую оценку. Приобрести дополнительно прохождение с сертификатом в таком случае нельзя.
Что я получу, оплатив сертификацию?
Оплатив сертификацию, вы получите доступ ко всем материалам курса, включая оцениваемые задания. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Is financial aid available?
Да, Coursera предоставляет финансовую помощь учащимся, которые не могут оплатить обучение. Чтобы подать заявление, перейдите по ссылке 'Финансовая помощь' слева под кнопкой 'Зарегистрироваться' и заполните форму. Если его примут, вы получите уведомление. Подробнее

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.

Big Data, Genes, and Medicine