Об этом курсе
Недавно просмотрено: 11,007

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Начальный уровень

Прибл. 25 часа на выполнение

Русский

Субтитры: Русский

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Начальный уровень

Прибл. 25 часа на выполнение

Русский

Субтитры: Русский

Программа курса: что вы изучите

Неделя
1
1 ч. на завершение

Неделя 1 - Введение (Week 1 - Introducton)

8 видео ((всего 61 мин.)), 1 тест
8 видео
Сиквенсные проекты (Sequencing Projects)3мин
Алгоритмы сборки (Assembly Algorithms)6мин
Подходы к анализу данных (Data Analysis Approaches)6мин
Знакомство с методами выделения геномной ДНК (Genomic DNA Isolation techniques overview) (13:49)13мин
Определение количества и качества ДНК (DNA quality and quantity control) (07:37)7мин
Подготовка ДНК-библиотек для секвенатора Illumina MiSeq (DNA-library preparation for Illumina MiSeq platform) (13:21)13мин
Запуск секвенатора Illumina MiSeq (Illumina MiSeq sequencer running) (03:25)3мин
1 практическое упражнение
Тест 1 (Quiz 1)20мин
Неделя
2
1 ч. на завершение

Неделя 2 - Технологии секвенирования (Sequencing Technologies)

4 видео ((всего 41 мин.)), 1 тест
4 видео
Обзор технологий нового поколения (NGS Technologies Overview)7мин
454, Ion Torrent, SOLiD, Illumina14мин
Synthetic Long Reads, PacBio, Oxford Nanopore9мин
1 практическое упражнение
Тест 2 (Quiz 2)20мин
Неделя
3
1 ч. на завершение

Неделя 3 - Контроль качества (Quality Control)

6 видео ((всего 50 мин.)), 1 тест
6 видео
Форматы данных, шкала Phred (Data Formats, Phred Scale)4мин
Проверка качества. FastQC (Quality Check. FastQC)10мин
Пример - часть 1 (Case Study - part 1)9мин
Пример - часть 2 (Case Study - part 2)8мин
Введение в Linux (Introduction to Linux)13мин
1 практическое упражнение
Тест 3 (Quiz 3)20мин
Неделя
4
2 ч. на завершение

Неделя 4 - Сборка ДНК de novo (De novo DNA assembly)

7 видео ((всего 72 мин.)), 1 тест
7 видео
Сборка ДНК de novo - часть 2 (De novo DNA assembly - part 2)15мин
Алгоритмы (Algorithms)6мин
Сложность алгоритмов (Algorithms Complexity)9мин
Overlap Layout Concensus9мин
Графы де Брюйна (De Bruijn Graphs)8мин
Алгоритмы сборки геномов (Genome Assembly Algorithms)10мин
1 практическое упражнение
Тест 4 (Quiz 4)20мин

Преподаватели

Avatar

Alla L Lapidus

Professor, Department of Cytology and Histology
Centre For Algorithmic Biotechnology
Avatar

Павел Добрынин

Младший научный сотрудник
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского
Avatar

Михаил Райко

Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского
Avatar

Екатерина Черняева

Постдок
Центр геномной биоинформатики им. Ф.Г.Добржанского

О Санкт-Петербургский государственный университет

Санкт-Петербургский государственный университет (СПбГУ) — старейший вуз России, основанный в 1724 году. Университет сегодня — научный, образовательный и культурный центр мирового значения, неизменно входящий во все международные рейтинги вузов. В номинации взаимодействие с работодателями QS Graduate Employability 2018 СПбГУ занимает 20 место среди 400 ведущих вузов мира и является лучшим в России. В настоящее время СПбГУ реализует 418 образовательных программ, включающих самые современные направления подготовки и специальности. Сертификат об успешном окончании представленных онлайн-курсов дает 5 дополнительных баллов при поступлении на программы магистратуры и аспирантуры СПбГУ. St Petersburg University is the oldest university in Russia, founded in 1724. The University today is a world-class research, educational and cultural centre which is always included in all international rankings of world universities. St Petersburg University was ranked 20th in QS Graduate Employability Ranking 2018 among 400 leading universities in the world and is the best in Russia. At present, St Petersburg University offers 418 academic programmes, including the most advanced areas and fields of study. The certificate of successful completion of offered online courses gives five additional points when applying for master’s and doctoral programmes at St Petersburg University....

Часто задаваемые вопросы

  • Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.

  • Оплатив сертификацию, вы получите доступ ко всем материалам курса, включая оцениваемые задания. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.