Об этом курсе

Недавно просмотрено: 23,969
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Начальный уровень
Прибл. 11 часов на выполнение
Русский
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Начальный уровень
Прибл. 11 часов на выполнение
Русский

от партнера

Placeholder

Санкт-Петербургский государственный университет

Программа курса: что вы изучите

Неделя
1

Неделя 1

2 ч. на завершение

Неделя 1 - Введение (Week 1 - Introducton)

2 ч. на завершение
8 видео ((всего 61 мин.))
8 видео
Сиквенсные проекты (Sequencing Projects)3мин
Алгоритмы сборки (Assembly Algorithms)6мин
Подходы к анализу данных (Data Analysis Approaches)6мин
Знакомство с методами выделения геномной ДНК (Genomic DNA Isolation techniques overview) (13:49)13мин
Определение количества и качества ДНК (DNA quality and quantity control) (07:37)7мин
Подготовка ДНК-библиотек для секвенатора Illumina MiSeq (DNA-library preparation for Illumina MiSeq platform) (13:21)13мин
Запуск секвенатора Illumina MiSeq (Illumina MiSeq sequencer running) (03:25)3мин
1 практическое упражнение
Тест 1 (Quiz 1)30мин
Неделя
2

Неделя 2

1 ч. на завершение

Неделя 2 - Технологии секвенирования (Sequencing Technologies)

1 ч. на завершение
4 видео ((всего 41 мин.))
4 видео
Обзор технологий нового поколения (NGS Technologies Overview)7мин
454, Ion Torrent, SOLiD, Illumina14мин
Synthetic Long Reads, PacBio, Oxford Nanopore9мин
1 практическое упражнение
Тест 2 (Quiz 2)30мин
Неделя
3

Неделя 3

1 ч. на завершение

Неделя 3 - Контроль качества (Quality Control)

1 ч. на завершение
6 видео ((всего 50 мин.))
6 видео
Форматы данных, шкала Phred (Data Formats, Phred Scale)4мин
Проверка качества. FastQC (Quality Check. FastQC)10мин
Пример - часть 1 (Case Study - part 1)9мин
Пример - часть 2 (Case Study - part 2)8мин
Введение в Linux (Introduction to Linux)13мин
1 практическое упражнение
Тест 3 (Quiz 3)30мин
Неделя
4

Неделя 4

2 ч. на завершение

Неделя 4 - Сборка ДНК de novo (De novo DNA assembly)

2 ч. на завершение
7 видео ((всего 72 мин.))
7 видео
Сборка ДНК de novo - часть 2 (De novo DNA assembly - part 2)15мин
Алгоритмы (Algorithms)6мин
Сложность алгоритмов (Algorithms Complexity)9мин
Overlap Layout Concensus9мин
Графы де Брюйна (De Bruijn Graphs)8мин
Алгоритмы сборки геномов (Genome Assembly Algorithms)10мин
1 практическое упражнение
Тест 4 (Quiz 4)30мин

Часто задаваемые вопросы

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.