In this course, you will learn how to use the BaseSpace cloud platform developed by Illumina (our industry partner) to apply several standard bioinformatics software approaches to real biological data. In particular, in a series of Application Challenges will see how genome assembly can be used to track the source of a food poisoning outbreak, how RNA-Sequencing can help us analyze gene expression data on the tissue level, and compare the pros and cons of whole genome vs. whole exome sequencing for finding potentially harmful mutations in a human sample. Plus, hacker track students will have the option to build their own genome assembler and apply it to real data!
Этот курс входит в специализацию ''Специализация Биоинформатика'
Bioinformatics Capstone: Big Data in Biology
от партнера
Об этом курсе
Недавно просмотрено: 2,003
Learner Career Outcomes
33%
начал новую карьеру, пройдя эти курсы
33%
получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу
Learner Career Outcomes
33%
начал новую карьеру, пройдя эти курсы
33%
получил значимые преимущества в карьере благодаря этому курсу
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Курс 7 из 7 в программе
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Начальный уровень
Прибл. 15 часов на выполнение
Предполагаемая нагрузка: 3 weeks of study, 3-4 hours/week
Английский
Субтитры: Английский
Программа курса: что вы изучите
5 ч. на завершение
Week 1: Identifying the Culprit in a Food Poisoning Outbreak
This week, we will apply genome sequencing algorithms to identify the bacterium causing a deadly food poisoning outbreak.
5 ч. на завершение
4 материалов для самостоятельного изучения
4 материала для самостоятельного изучения
Welcome to Class!10мин
Special Thanks2мин
Introduction15мин
Databases and Tools5мин
4 ч. на завершение
Week 2: Comparing Gene Expression in Tissue Samples with RNA-Seq
In this week's Application Challenge, we will learn how RNA-Sequencing can be applied to perform tissue-level gene expression analysis. In particular, which is more similar on a gene expression level: different tissues from the same organism, or analogous tissues from related species? This question was the subject of recent debate and a Twitter controversy -- read more to find out!
4 ч. на завершение
2 материалов для самостоятельного изучения
2 материала для самостоятельного изучения
Introduction15мин
Databases and Tools5мин
5 ч. на завершение
Week 3: Weighing the Pros and Cons of Whole Genome and Whole Exome Sequencing on a Human Sample
Comparing the differences between sequencing an entire human genome and sequencing only the exome, or the DNA that is eventually translated into protein. Can we obtain a complete picture of someone's genetic disease predispositions from only the exome, or is there information lurking in introns that can provide doctors with vital information? How do we weigh the trade-offs when considering genome and exome sequencing?
5 ч. на завершение
4 материалов для самостоятельного изучения
4 материала для самостоятельного изучения
Introduction15мин
Databases and Tools10мин
Walkthroughs15мин
Reading: Part 3 FAQs
4.6
Рецензии: 4Лучшие отзывы о курсе Bioinformatics Capstone: Big Data in Biology
I hope that the links to access data in the peer graded assignments gets fixed soon!
О Калифорнийский университет в Сан-Диего
UC San Diego is an academic powerhouse and economic engine, recognized as one of the top 10 public universities by U.S. News and World Report. Innovation is central to who we are and what we do. Here, students learn that knowledge isn't just acquired in the classroom—life is their laboratory.
Специализация Биоинформатика: общие сведения
Join Us in a Top 50 MOOC of All Time!
How do we sequence and compare genomes? How do we identify the genetic basis for disease? How do we construct an evolutionary Tree of Life for all species on Earth?
When you complete this Specialization, you will learn how to answer many questions in modern biology that have become inseparable from the computational approaches used to solve them. You will also obtain a toolkit of existing software resources built on these computational approaches and that are used by thousands of biologists every day in one of the fastest growing fields in science.
Although this Specialization centers on computational topics, you do not need to know how to program in order to complete it. If you are interested in programming, we feature an "Honors Track" (called "hacker track" in previous runs of the course). The Honors Track allows you to implement the bioinformatics algorithms that you will encounter along the way in dozens of automatically graded coding challenges. By completing the Honors Track, you will be a bioinformatics software professional!
Learn more about the Bioinformatics Specialization (including why we are wearing these crazy outfits) by watching our introductory video.
You can purchase the Specialization's print companion, Bioinformatics Algorithms: An Active Learning Approach, from the textbook website.
Our first course, "Finding Hidden Messages in DNA", was named a top-50 MOOC of all time by Class Central!
Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.
Что я получу, оформив подписку на специализацию?
Записавшись на курс, вы получите доступ ко всем курсам в специализации, а также возможность получить сертификат о его прохождении. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.
Какие правила возврата средств?
Можно ли получить финансовую помощь?
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.
© Coursera Inc., 2020 Все права защищены.
