Об этом курсе
Недавно просмотрено: 2,186

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Промежуточный уровень

Прибл. 14 часа на выполнение

Предполагаемая нагрузка: 4-5 hours/week...

Английский

Субтитры: Английский

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.

Промежуточный уровень

Прибл. 14 часа на выполнение

Предполагаемая нагрузка: 4-5 hours/week...

Английский

Субтитры: Английский

Программа курса: что вы изучите

Неделя
1
2 ч. на завершение

The Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS) Program Overview

This module provides an overview of the concept behind the LINCS program; and tutorials on how to get started with using the LINCS L1000 dataset.

...
8 видео ((всего 78 мин.)), 2 материалов для самостоятельного изучения
8 видео
The Connectivity Map8мин
Geometrical View of the Connectivity Map Concept3мин
LINCS Data and Signature Generation Centers12мин
BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center4мин
Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs)4мин
Introduction to LINCS L1000 Data22мин
L1000 Characteristic Direction Signature Search Engine (L1000CDS2) Demo13мин
2 материала для самостоятельного изучения
Syllabus10мин
Grading and Logistics10мин
26 минуты на завершение

Metadata and Ontologies

This module includes a broad high level description of the concepts behind metadata and ontologies and how these are applied to LINCS datasets.

...
2 видео ((всего 26 мин.))
2 видео
Introduction to Metadata and Ontologies | Part 220мин
24 минуты на завершение

Serving Data with APIs

In this module we explain the concept of accessing data through an application programming interface (API).

...
2 видео ((всего 19 мин.))
2 видео
Accessing and Serving Data through RESTful APIs | Part 210мин
Неделя
2
19 минуты на завершение

Bioinformatics Pipelines

This module describes the important concept of a Bioinformatics pipeline.

...
1 видео ((всего 14 мин.))
1 ч. на завершение

The Harmonizome

This module describes a project that integrates many resources that contain knowledge about genes and proteins. The project is called the Harmonizome, and it is implemented as a web-server application available at: http://amp.pharm.mssm.edu/Harmonizome/

...
4 видео ((всего 37 мин.))
4 видео
Processing Datasets | Part 18мин
Processing Datasets | Part 29мин
Processing Datasets | Part 37мин
Неделя
3
24 минуты на завершение

Data Normalization

This module describes the mathematical concepts behind data normalization.

...
2 видео ((всего 19 мин.))
2 видео
Data Normalization | Part 213мин
1 ч. на завершение

Data Clustering

This module describes the mathematical concepts behind data clustering, or in other words unsupervised learning - the identification of patterns within data without considering the labels associated with the data.

...
3 видео ((всего 33 мин.))
3 видео
Data Clustering | Part 2 | Distance Functions 12мин
Data Clustering | Part 3 | Algorithms and Evaluation15мин
2 ч. на завершение

Midterm Exam

The Midterm Exam consists of 45 multiple choice questions which covers modules 1-7. Some of the questions may require you to perform some analysis with the methods you learned throughout the course on new datasets.

...
1 тест
1 практическое упражнение
Midterm Exam1ч 30мин
Неделя
4
29 минуты на завершение

Enrichment Analysis

This module introduces the important concept of performing gene set enrichment analyses. Enrichment analysis is the process of querying gene sets from genomics and proteomics studies against annotated gene sets collected from prior biological knowledge.

...
3 видео ((всего 29 мин.))
3 видео
Enrichment Analysis | Part 27мин
Enrichr Demo9мин
1 ч. на завершение

Machine Learning

This module describes the mathematical concepts of supervised machine learning, the process of making predictions from examples that associate observations/features/attribute with one or more properties that we wish to learn/predict.

...
3 видео ((всего 27 мин.))
3 видео
Introduction to Machine Learning | Part 2 8мин
Introduction to Machine Learning | Part 39мин
4.9
Рецензии: 4Chevron Right

Лучшие отзывы о курсе Наука о больших данных с "BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center"

автор: MSJan 21st 2017

A very practical courses. Very good introduction to Big Data sources and Computational Analysis tool.

автор: HHSep 19th 2018

excellent oppurtunity for the data science learners

Преподаватели

Avatar

Avi Ma’ayan, PhD

Director, Mount Sinai Center for Bioinformatics
Professor, Department of Pharmacological Sciences

О Школа Медицины Икан на горе Синай

The Icahn School of Medicine at Mount Sinai, in New York City is a leader in medical and scientific training and education, biomedical research and patient care....

Часто задаваемые вопросы

  • Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.

  • Оплатив сертификацию, вы получите доступ ко всем материалам курса, включая оцениваемые задания. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.