Об этом курсе
5.0
Оценки: 12
Рецензии: 4
100% онлайн

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Гибкие сроки

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Промежуточный уровень

Промежуточный уровень

Часов на завершение

Прибл. 14 часа на выполнение

Предполагаемая нагрузка: 4-5 hours/week...
Доступные языки

Английский

Субтитры: Английский
100% онлайн

100% онлайн

Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Гибкие сроки

Гибкие сроки

Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Промежуточный уровень

Промежуточный уровень

Часов на завершение

Прибл. 14 часа на выполнение

Предполагаемая нагрузка: 4-5 hours/week...
Доступные языки

Английский

Субтитры: Английский

Программа курса: что вы изучите

Неделя
1
Часов на завершение
2 ч. на завершение

The Library of Integrated Network-based Cellular Signatures (LINCS) Program Overview

This module provides an overview of the concept behind the LINCS program; and tutorials on how to get started with using the LINCS L1000 dataset....
Reading
8 videos (Total 78 min), 2 материалов для самостоятельного изучения
Video8 видео
The Connectivity Map8мин
Geometrical View of the Connectivity Map Concept3мин
LINCS Data and Signature Generation Centers12мин
BD2K-LINCS Data Coordination and Integration Center4мин
Induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs)4мин
Introduction to LINCS L1000 Data22мин
L1000 Characteristic Direction Signature Search Engine (L1000CDS2) Demo13мин
Reading2 материала для самостоятельного изучения
Syllabus10мин
Grading and Logistics10мин
Часов на завершение
26 минуты на завершение

Metadata and Ontologies

This module includes a broad high level description of the concepts behind metadata and ontologies and how these are applied to LINCS datasets....
Reading
2 videos (Total 26 min)
Video2 видео
Introduction to Metadata and Ontologies | Part 220мин
Часов на завершение
24 минуты на завершение

Serving Data with APIs

In this module we explain the concept of accessing data through an application programming interface (API)....
Reading
2 videos (Total 19 min)
Video2 видео
Accessing and Serving Data through RESTful APIs | Part 210мин
Неделя
2
Часов на завершение
19 минуты на завершение

Bioinformatics Pipelines

This module describes the important concept of a Bioinformatics pipeline....
Reading
1 video (Total 14 min)
Часов на завершение
1 ч. на завершение

The Harmonizome

This module describes a project that integrates many resources that contain knowledge about genes and proteins. The project is called the Harmonizome, and it is implemented as a web-server application available at: http://amp.pharm.mssm.edu/Harmonizome/ ...
Reading
4 videos (Total 37 min)
Video4 видео
Processing Datasets | Part 18мин
Processing Datasets | Part 29мин
Processing Datasets | Part 37мин
Неделя
3
Часов на завершение
24 минуты на завершение

Data Normalization

This module describes the mathematical concepts behind data normalization....
Reading
2 videos (Total 19 min)
Video2 видео
Data Normalization | Part 213мин
Часов на завершение
1 ч. на завершение

Data Clustering

This module describes the mathematical concepts behind data clustering, or in other words unsupervised learning - the identification of patterns within data without considering the labels associated with the data. ...
Reading
3 videos (Total 33 min)
Video3 видео
Data Clustering | Part 2 | Distance Functions 12мин
Data Clustering | Part 3 | Algorithms and Evaluation15мин
Часов на завершение
2 ч. на завершение

Midterm Exam

The Midterm Exam consists of 45 multiple choice questions which covers modules 1-7. Some of the questions may require you to perform some analysis with the methods you learned throughout the course on new datasets. ...
Reading
1 тест
Quiz1 практическое упражнение
Midterm Exam30мин
Неделя
4
Часов на завершение
29 минуты на завершение

Enrichment Analysis

This module introduces the important concept of performing gene set enrichment analyses. Enrichment analysis is the process of querying gene sets from genomics and proteomics studies against annotated gene sets collected from prior biological knowledge....
Reading
3 videos (Total 29 min)
Video3 видео
Enrichment Analysis | Part 27мин
Enrichr Demo9мин
Часов на завершение
1 ч. на завершение

Machine Learning

This module describes the mathematical concepts of supervised machine learning, the process of making predictions from examples that associate observations/features/attribute with one or more properties that we wish to learn/predict....
Reading
3 videos (Total 27 min)
Video3 видео
Introduction to Machine Learning | Part 2 8мин
Introduction to Machine Learning | Part 39мин

Преподаватель

Avatar

Avi Ma’ayan, PhD

Director, Mount Sinai Center for Bioinformatics
Professor, Department of Pharmacological Sciences

О Icahn School of Medicine at Mount Sinai

The Icahn School of Medicine at Mount Sinai, in New York City is a leader in medical and scientific training and education, biomedical research and patient care....

Часто задаваемые вопросы

  • Зарегистрировавшись на сертификацию, вы получите доступ ко всем видео, тестам и заданиям по программированию (если они предусмотрены). Задания по взаимной оценке сокурсниками можно сдавать и проверять только после начала сессии. Если вы проходите курс без оплаты, некоторые задания могут быть недоступны.

  • Оплатив сертификацию, вы получите доступ ко всем материалам курса, включая оцениваемые задания. После успешного прохождения курса на странице ваших достижений появится электронный сертификат. Оттуда его можно распечатать или прикрепить к профилю LinkedIn. Просто ознакомиться с содержанием курса можно бесплатно.

Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.