In this capstone project course, we'll compare genome sequences of COVID-19 mutations to identify potential areas a drug therapy can look to target. The first step in drug discovery involves identifying target subsequences of theirs genome to target. We'll start by comparing the genomes of virus mutations to look for similarities. Then, we'll perform PCA to cut down our number of dimensions and identify the most common features. Next, we'll use K-means clustering in Python to find the optimal number of groups and trace the lineage of the virus. Finally, we'll predict similarity between the sequences and use this to pick a target subsequence. Throughout the course, each section will consist of a programming assignment coupled with a guide video and helpful hints. By the end, you'll be well on your way to discovering ways to combat disease with genome sequencing.
Этот курс входит в специализацию ''Специализация AI for Scientific Research'
от партнера


Об этом курсе
Недавно просмотрено: 2 700
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Лабораторные работы Coursera Labs
Включает в себя практические учебные проекты.
Подробнее о лабораторных работах Coursera Labs Курс 4 из 4 в программе
Средний уровень
We recoomend that you take the other two courses in the specizliation (or are familiar with the content) before attempting this capstone project.
Прибл. 12 часов на выполнение
Английский
Чему вы научитесь
Analyzing genome sequences to find similarities and identify target subsequences using predctive models.
Приобретаемые навыки
- Whole Genome Sequencing
- Machine Learning
- Drug Discovery
- Dimensionality Reduction
- K-Means Clustering
Гибкие сроки
Назначьте сроки сдачи в соответствии со своим графиком.
Сертификат, ссылками на который можно делиться с другими людьми
Получите сертификат по завершении
100% онлайн
Начните сейчас и учитесь по собственному графику.
Лабораторные работы Coursera Labs
Включает в себя практические учебные проекты.
Подробнее о лабораторных работах Coursera Labs Курс 4 из 4 в программе
Средний уровень
We recoomend that you take the other two courses in the specizliation (or are familiar with the content) before attempting this capstone project.
Прибл. 12 часов на выполнение
Английский
от партнера
Программа курса: что вы изучите
3 ч. на завершение
Comparing Genome Sequences
3 ч. на завершение
4 видео ((всего 7 мин.))
3 ч. на завершение
Principal Component Analysis on Genome Sequences
3 ч. на завершение
2 видео ((всего 3 мин.)), 1 материал для самостоятельного изучения, 1 тест
3 ч. на завершение
Feature Analysis using K-Means Clustering
3 ч. на завершение
2 видео ((всего 2 мин.))
3 ч. на завершение
Predicting Bit Score to Find Sequence Matches
3 ч. на завершение
2 видео ((всего 3 мин.))
Специализация AI for Scientific Research: общие сведения

Часто задаваемые вопросы
Когда я получу доступ к лекциям и заданиям?
Что я получу, оформив подписку на специализацию?
Можно ли получить финансовую помощь?
Остались вопросы? Посетите Центр поддержки учащихся.